1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
ACTCCTCCACATGATCTTCATATTTCTGATTGTCTATATGATTTGCATCCCGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATGgtttgttcctttgctcaacatattcttctacttttactgtttactatggtctttagaatatggttaaagagatatttaaacaagcataaaacaagagtgg...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA02G44660.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATG GTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAAEST: gi|14259413|gb|BG882321.1|BG882321
genomic: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATGgtttgttcct ... tttatggcagGTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAA
EST: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATG GTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAAEST: gi|58021523|gb|CX708264.1|CX708264
genomic: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATGgtttgttcct ... tttatggcagGTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAA
EST: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATG GTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAAEST: gi|58024547|gb|CX711288.1|CX711288
genomic: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATGgtttgttcct ... tttatggcagGTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAA
EST: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATG GTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAAEST: gi|19053546|gb|BM732213.1|BM732213
genomic: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATGgtttgttcct ... tttatggcagGTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAA
EST: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATG GTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAAEST: gi|57575974|gb|CX548945.1|CX548945
genomic: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATGgtttgttcct ... tttatggcagGTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAA
EST: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATG GTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAA
genomic: CGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATGgtttgttcct ... tttatggcagGTTGGTGGTATGGTGTTGTAGGCCACTTGGAAGTATGCGATGGGAATGAAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ACTCCTCCACATGATCTTCATATTTCTGATTGTCTATATGATTTGCATCCCGGTGATCACGTAGAGATTCAGTGGAGAAGAAACAAAGAATTTCCTTATGgtttgttcctttgctcaacatattcttctacttttactgtttactatggtctttagaatatggttaaagagatatttaaacaagcataaaacaagagtgg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAAGAA