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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGGACTACTGCCTGATACTGACTATGTTGTTAAAGTGGCTAAAAGGGACGTGGGCAGTTCTAATATAGAGCGTGCATCTCCAGATTCTATTGCTGTCAAGgttagttcccggtagctatctgctttagatttgctgtcaatgttctgctctgttgtaagcttgggttgatgttcccag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G40520.1
intron # 24
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193455311|gb|FK417818.1|FK417818
EST:     TGGGCAGTTCTAATATAGAGCGTGCATCTCCAGATTCTATTGCTGTCAAG                         GCTGGAACTGAGGATATCAAGGGATTGGATTTTATAGTTTTTGAGGAGCCG
genomic: TGGGCAGTTCTAATATAGAGCGTGCATCTCCAGATTCTATTGCTGTCAAGgttagttccc ... atgttcccagGTTGGAACTGAGGATATCAAGGGATTGGATTTTATAGTTTTTGAGGAGCCG
EST: gi|51338061|gb|CO981927.1|CO981927
EST:     TGGGCAGTTCTAATATAGAGCGTGCATCTCCAGATTCTATTGCTGTCAAG                         GTTGGAACTGAGGATATCAAGGGATTGGATTTTATAGTTTTTGAGGAGCCG
genomic: TGGGCAGTTCTAATATAGAGCGTGCATCTCCAGATTCTATTGCTGTCAAGgttagttccc ... atgttcccagGTTGGAACTGAGGATATCAAGGGATTGGATTTTATAGTTTTTGAGGAGCCG