1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
21 5' 3' | 22 5' 3' | 23 5' 3' | 24 5' 3' | 25 5' 3' |
ATGCCTACGCTTATGATAAAAGTGAAATGGAGGAGGTTTCAATGGTTGCACTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAAgtaagctctaatattagtagctattgatgcaactgttacttttacttttaattagttatgaaatttaaagaactacctggttcatactgtttccgnnnnn...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G37090.1 |
intron # | 24 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAA TTCCTTTACTATATTGCAATATATGGCTATATGGGGTAATTTGGCTGCCTTEST: gi|193569794|gb|FK524473.1|FK524473
genomic: CTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAAgtaagctcta ... ttttatgcagTTCCTTTACTATATTGCAATATATGGCTATATGGGGTAATTTGGCTGCCTT
EST: CTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAA TTCCTTTACTATATTGCAATATATGGCTATATGGGGTAATTTGGCTTGCCTEST: gi|10254578|gb|BE822344.1|BE822344
genomic: CTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAAgtaagctcta ... ttttatgcagTTCCTTTACTATATTGCAATATATGGCTATATGGGGTAATTTGGC-TGCCT
EST: CTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTANNAATGGAGACCAA TTCCTTTACTATATTGCAATATATGGCTATATGGGGTAATTTGGCTGCCTTEST: gi|192300036|gb|FG991854.1|FG991854
genomic: CTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAAgtaagctcta ... ttttatgcagTTCCTTTACTATATTGCAATATATGGCTATATGGGGTAATTTGGCTGCCTT
EST: CTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAA TTCCTTTACTATATTGCAATATATGGCTATATGGGGTAATTTGGCTGCCTTEST: gi|6666069|gb|AW277528.1|AW277528
genomic: CTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAAgtaagctcta ... ttttatgcagTTCCTTTACTATATTGCAATATATGGCTATATGGGGTAATTTGGCTGCCTT
EST: CTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAA TTCCTTTACTATATTGCAATATATGGCTATATGGGGTAATTTGGCTGCCTT
genomic: CTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAAgtaagctcta ... ttttatgcagTTCCTTTACTATATTGCAATATATGGCTATATGGGGTAATTTGGCTGCCTT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATGCCTACGCTTATGATAAAAGTGAAATGGAGGAGGTTTCAATGGTTGCACTTTCCGGGTGTATATGGATACAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAGACCAAgtaagctctaatattagtagctattgatgcaactgttacttttacttttaattagttatgaaatttaaagaactacctggttcatactgtttccgnnnnn
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA