Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   		26  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TAATGTGTCCTATAACAAACTATTTGGTGTTATCCCCACGAGTAACAACTTTACCAGGTTTCCCCCTGACAGgtgagggagggtcattcacttttgacattgtctttaactttaaaacaagttgttcttgattcatacaaccttttatttgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA14G11220.2
intron # 22
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193422179|gb|FK387188.1|FK387188
EST:     TTTGGTGTTATCCCCACGAGTAACAACTTTACCAGGTTTCCCCCTGACAG                         TTTCATTGGAAACCCTGGTCTTTGTGGTAATTGGCTGAATTTGCCATGCCA
genomic: TTTGGTGTTATCCCCACGAGTAACAACTTTACCAGGTTTCCCCCTGACAGgtgagggagg ... ttatttgcagTTTCATTGGAAACCCTGGTCTTTGTGGTAATTGGCTGAATTTGCCATGCCA
EST: gi|27424345|gb|CA935865.1|CA935865
EST:     TTTGGTGTTATCCCCACGAGTAACAACTTTACCAGGTTTCCCCCTGACAG                         TTTCATTGGAAACCCTGGTCTTTGTGGTAATTGGCTGAATTTGCCATGCCA
genomic: TTTGGTGTTATCCCCACGAGTAACAACTTTACCAGGTTTCCCCCTGACAGgtgagggagg ... ttatttgcagTTTCATTGGAAACCCTGGTCTTTGTGGTAATTGGCTGAATTTGCCATGCCA
EST: gi|193435196|gb|FK399850.1|FK399850
EST:     TTGGTGTTATCCCCACGAGTAACAACTTTACCAGGTTTCCCCCTCGACAG                         TTTCATTGGAAACCCT
genomic: TTGGTGTTATCCCCACGAGTAACAACTTTACCAGGTTTCCCCCT-GACAGgtgagggagg ... ttatttgcagTTTCATTGGAAACCCT
EST: gi|193362840|gb|FK324432.1|FK324432
EST:     TTTGGTGTTATCCCCACGAGTAACAACTTTACCAGGTTT-CCCCTGACAG                         TTTCATTGGAAACCCTGGTCTTTGTGGTAATTGGCTGAATTTGCCATGCCA
genomic: TTTGGTGTTATCCCCACGAGTAACAACTTTACCAGGTTTCCCCCTGACAGgtgagggagg ... ttatttgcagTTTCATTGGAAACCCTGGTCTTTGTGGTAATTGGCTGAATTTGCCATGCCA