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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CCGTCGAACGTATGGATTTCTATTTGATTGGTTGTATCCTGCACACATGCCTCTACTCTTAAAAGGCATCTCACATTGGACAGACACCCCTGAGgtaatgaaccttgtggataattttttatgcatacatatacactcaaatggtgggttttgatcccattattcttcactcatgtaaaattgaagatctgtga...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA04G00430.1
intron # 21
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA04G00430.1 (Glycine max), 5'ss of exon 21
lower sequence: Vv13s0067g01920.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 23
CCGTCGAACGTATGGATTTCTATTTGATTGGTTGTATCCTGCACACATGCCTCTACTCTTAAAAGGCATCTCACATTGGACAGACACCCCTGAGgtaatgaaccttgtggataattttttatgcatacatatacactcaaatggtgggttttgatcccattattcttcactcatgtaaaatt-gaagatctgtga--
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CCGCAGAACTTACGGGCTTCTATTTGATTGGTTGTATCCTGCACATATGCCACTTCTCTTGAAAGGCATTTCGCACTGGACCGATACACCAGAGgtgaagtaaa--atggttattttcttccttatttg-atatattggacatggaagtggcccttttatcattaagtagtcaacttaaatcagaatggtcgtgtgc