Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   		26  
 5'  3'   		27  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGGTCAGTTAAATGTGGAAAGTAATTCATCTGATGCTGAAACAATTGAGGCTGAATTAGAACTTAGTGAATTACTGCTAAGTTTGCGTCCTATTAAGCAGgtttggttttctgtgtaatctaacaaattactattcttgcttgttgatataattttcttcctattttttagtggaattttactgaacaccttggggttccttcctatttattatgcttctctggtgactttgttgtatttttgcttcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G35190.1
intron # 20
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|254340254|gb|GR858379.1|GR858379
EST:     CTGAATTAGAACTTAGTGAATTACTGCTAAGTTTGCGTCCTATTAAGCAG                         GAAAACCTAATCCATGATGACAACAAACTTATTCTGTTGGCATCCCTTAGT
genomic: CTGAATTAGAACTTAGTGAATTACTGCTAAGTTTGCGTCCTATTAAGCAGgtttggtttt ... tttgcttcagGAAAACCTAATCCATGATGACAACAAACTTATTCTGTTGGCATCCCTTAGT
EST: gi|26058666|gb|CA801580.1|CA801580
EST:     CTGAATTAGAACTTAGTGAATTACTGCTAAGTTTGCGTCCTATTAAGCAG                         GAAAACCTAATCCATGATGACAACAAACTTATTCTGTTGGCATCCCTTAGT
genomic: CTGAATTAGAACTTAGTGAATTACTGCTAAGTTTGCGTCCTATTAAGCAGgtttggtttt ... tttgcttcagGAAAACCTAATCCATGATGACAACAAACTTATTCTGTTGGCATCCCTTAGT