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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CCCGAACTTAACATCTTTGAACTTGAGCTATGCAGCAGGCATTCAGGGAAGTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGGgtaaatctatcaaattcaaatcttttttctgttatatttgttgattcttatattggtgaatatcaataaattttagacttgtgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G27280.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|207748090|gb|GD719409.1|GD719409
EST:     TAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGG                         ATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACACGT
genomic: TAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGGgtaaatctat ... acttgtgcagATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACATGT
EST: gi|208044900|gb|GD843676.1|GD843676
EST:     TAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGG                         ATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACACGT
genomic: TAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGGgtaaatctat ... acttgtgcagATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACATGT
EST: gi|254322836|gb|GR839857.1|GR839857
EST:     GTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGG                         ATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACATGT
genomic: GTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGGgtaaatctat ... acttgtgcagATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACATGT
EST: gi|5760644|gb|AI966007.1|AI966007
EST:     GTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGG                         ATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACATGT
genomic: GTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGGgtaaatctat ... acttgtgcagATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACATGT
EST: gi|4306821|gb|AI443959.1|AI443959
EST:     GTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGG                         ATAATGGATTGCATTGGAGACA
genomic: GTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGGgtaaatctat ... acttgtgcagATAATGGATTGCATTGGAGACA
EST: gi|254338799|gb|GR847516.1|GR847516
EST:     GTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGG                         ATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACATGT
genomic: GTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGGgtaaatctat ... acttgtgcagATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACATGT
EST: gi|192321373|gb|FK012134.1|FK012134
EST:     GTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGG                         ATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACATGT
genomic: GTGCTCTGGTAAAACTAATTCATCACTGTGTTAAACTTCAGCGCTTATGGgtaaatctat ... acttgtgcagATAATGGATTGCATTGGAGACAAAGGACTAGGTGTTGTAGCTACGACATGT