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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AACCAAAGAAATCAACTACAAAGCAATTTGATCGAATAGATAACTTATTTGAGTCATATGCAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGAgtaagtatgtgcattttgaaatcattatgacatgctttattgttgttcgatctgctttaggattaagaatatgttatgattaagttagattcaattattt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA17G11180.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298186426|gb|HO037059.1|HO037059
EST:     ATAGATAACTTATTTGAGTCATATGCAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGA                         CCCAGACGGGATTGAAGCACTTTGTAAAGATGTGCATGTGGACCGCACAGA
genomic: ATAGATAACTTATTTGAGTCATATGCAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGAgtaagtatgt ... ggttggtcagCCCAGACGGGATTGAAGCACTTTGTAAAGATGTGCATGTGGACCACACAGA
EST: gi|8283093|gb|BE020654.1|BE020654
EST:     ATAGATAACTTATTTGAGTCATATGCAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGA                         CCCAGACGGGATTGAAGCACTTTGTAAAGATGTGCATGTGGACCACACAGA
genomic: ATAGATAACTTATTTGAGTCATATGCAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGAgtaagtatgt ... ggttggtcagCCCAGACGGGATTGAAGCACTTTGTAAAGATGTGCATGTGGACCACACAGA
EST: gi|192331362|gb|FK021030.1|FK021030
EST:     ATAGATAACTTATTTGAGTCATATGCAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGA                         CCCAGACGGGATTGAAGCACTTTGTAAAGATGTGCATGTGGACCACACAGA
genomic: ATAGATAACTTATTTGAGTCATATGCAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGAgtaagtatgt ... ggttggtcagCCCAGACGGGATTGAAGCACTTTGTAAAGATGTGCATGTGGACCACACAGA
EST: gi|19053005|gb|BM731672.1|BM731672
EST:     CAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGA                         CCCAGACGGGATTGAAGCACTTTGTAAAGATGTGCATGTGGACCACACAGA
genomic: CAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGAgtaagtatgt ... ggttggtcagCCCAGACGGGATTGAAGCACTTTGTAAAGATGTGCATGTGGACCACACAGA
EST: gi|192326675|gb|FK018517.1|FK018517
EST:     ATAGATAACTTATTTGAGTCATATGCAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGA                         CCCAGACGGGATTGAAGCACTTTGTAAAGATGTGCATGTGGACCACACAGA
genomic: ATAGATAACTTATTTGAGTCATATGCAAATAAGTCATTGGGTTTAATTGAgtaagtatgt ... ggttggtcagCCCAGACGGGATTGAAGCACTTTGTAAAGATGTGCATGTGGACCACACAGA