Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTCGGAGAAAGTGCTTGTCAAGTGCCTCGTGATGAACGACAAATTGCTCGTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGAgtaattgattcttttccctttttttttgttttggttgaaaatttaattgtttccatctggttgagaagttagggtttttgagtgggttttctttatcgtg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA15G17840.2
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|18040483|gb|BM308777.1|BM308777
EST:     GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGA                         TGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
genomic: GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGAgtaattgatt ... tgatatgcagTGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
EST: gi|7693170|gb|AW761267.1|AW761267
EST:     GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGA                         TGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
genomic: GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGAgtaattgatt ... tgatatgcagTGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
EST: gi|151408833|gb|EV278641.1|EV278641
EST:     GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGA                         TGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
genomic: GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGAgtaattgatt ... tgatatgcagTGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
EST: gi|151401061|gb|EV270875.1|EV270875
EST:     GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGA                         TGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
genomic: GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGAgtaattgatt ... tgatatgcagTGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
EST: gi|298198745|gb|HO042108.1|HO042108
EST:     GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGA                         TGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
genomic: GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGAgtaattgatt ... tgatatgcagTGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
EST: gi|24135432|gb|BU925942.1|BU925942
EST:     GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGA                         TGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
genomic: GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGAgtaattgatt ... tgatatgcagTGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
EST: gi|33389848|gb|CA853055.1|CA853055
EST:     GGGTCNTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGA                         TGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
genomic: GGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGAgtaattgatt ... tgatatgcagTGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
EST: gi|192300523|gb|FG991505.1|FG991505
EST:     GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGA                         TGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCATTT
genomic: GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGAgtaattgatt ... tgatatgcagTGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
EST: gi|298168531|gb|HO009461.1|HO009461
EST:     GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGA                         TGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT
genomic: GTTCATGCTTTGACTCAAGGGTCGTCGGAGCCTTTGAGCCTTGAGATTGAgtaattgatt ... tgatatgcagTGTTGGGGATTATGCTGAAGAGGATGGAGGCAGCAATTATTCTCAGCAGTT