Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCAATCCGTCTTTGAAGTGGACCAAAGCCTCCCTCAAATTTCCCTATGTCATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAGgttagcaatcttatccttgaaatttaaattaaagaggaaataaaataaaaacaattataaaagtcaacctttttgtgtttgcaattgtgtttttcttctgaacttatgtggggtggactgtcaaccaatcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA15G10460.2
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|20814708|gb|BQ299186.1|BQ299186
EST:     ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAG                         GCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
genomic: ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAGgttagcaatc ... aaccaatcagGCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
EST: gi|298190400|gb|HO032521.1|HO032521
EST:     ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAG                         GCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
genomic: ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAGgttagcaatc ... aaccaatcagGCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
EST: gi|22541410|gb|BU091253.1|BU091253
EST:     ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAG                         GCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGNTTACATCAAG
genomic: ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAGgttagcaatc ... aaccaatcagGCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
EST: gi|9258484|gb|BE346631.1|BE346631
EST:     ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAG                         GCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
genomic: ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAGgttagcaatc ... aaccaatcagGCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
EST: gi|6454692|gb|AW185375.1|AW185375
EST:     ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAG                         GCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
genomic: ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAGgttagcaatc ... aaccaatcagGCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
EST: gi|298194851|gb|HO043323.1|HO043323
EST:     ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAG                         GCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
genomic: ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAGgttagcaatc ... aaccaatcagGCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
EST: gi|298165770|gb|HO008741.1|HO008741
EST:     ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAG                         GCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG
genomic: ATTTTCTGTGCTCCCCCTTACCAATCCTCAGACTACCTTGGTGATCTTAGgttagcaatc ... aaccaatcagGCTGGCTGCATCATGCTGGAATGGTGAAGGTGCTTTGCTGTTTACATCAAG