Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AATGGGACCACTGAGGAGGTAAAGAAGATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagacttagctagcttctgatgggattgtctttttttgtggaaaacattttgtacttatcacacactcttgcgatggtctatctggctaagtaaattg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA15G04290.2
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA15G04290.2 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: Vv06s0004g04800.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 2
AATGGGACCACTGAGGAGGTAAAGAAGATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagacttagctagcttctgatgggattgtctttttttgtggaaaac-attttgtacttatcaca-cactcttgcgatggtctatctggctaagtaa-attg-
||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| | || |||||| | || | | | |||| | ||| | || || | | | |||| | | || | | | | ||| | ||
AATGGAACAGTTGAGGAGGTGAAGAAGATTGTTACTGTTTTGAATGAGGCTGAAGTTCCGTCCGAAGACATTGTGGgtgag-ttgagttg---tgcagtttctatgtcatatttcattgaccactgaatgggatgcatcagagtatggtttacaaaatttcccaaactagcaagcatcat
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|151402600|gb|EV272413.1|EV272413
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208163268|gb|GD965736.1|GD965736
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAA
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAA
EST: gi|298172150|gb|HO021742.1|HO021742
EST:     GATTGTTACCACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208334926|gb|GE132871.1|GE132871
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTT
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTT
EST: gi|208170073|gb|GD967068.1|GD967068
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGCAAAAAGCTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|192330567|gb|FK022698.1|FK022698
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193355956|gb|FK319155.1|FK319155
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGGAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|209714947|gb|BW650793.1|BW650793
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|298167922|gb|HO013185.1|HO013185
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208251558|gb|GE049183.1|GE049183
EST:     ATTGTTACTTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: ATTGTTAC-TACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193555326|gb|FK512243.1|FK512243
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTGAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207776286|gb|GD749607.1|GD749607
EST:     AGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: AGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208115030|gb|GD910373.1|GD910373
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGAAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAG
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAG
EST: gi|33388216|gb|CA851423.1|CA851423
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGNGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|17020677|gb|BM091711.1|BM091711
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193343321|gb|FK307385.1|FK307385
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|19935084|gb|BQ080114.1|BQ080114
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|6455637|gb|AW186320.1|AW186320
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTNCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193473899|gb|FK441548.1|FK441548
EST:     CTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: CTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|298187234|gb|HO034383.1|HO034383
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208258112|gb|GE055791.1|GE055791
EST:     ATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTACCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTT
genomic: ATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGT-CCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTT
EST: gi|15203172|gb|BI425940.1|BI425940
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|213598487|gb|DB958127.1|DB958127
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|24205173|gb|BU964426.1|BU964426
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTATAATAGTTTG
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAA-AGTTTG
EST: gi|298197518|gb|HO044997.1|HO044997
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207803881|gb|GD773610.1|GD773610
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGAAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAG
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAG
EST: gi|298173782|gb|HO017118.1|HO017118
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|16997158|gb|BM086530.1|BM086530
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208060615|gb|GD857055.1|GD857055
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|298195199|gb|HO043727.1|HO043727
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|7326922|gb|AW620720.1|AW620720
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|298186175|gb|HO036808.1|HO036808
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208039313|gb|GD832371.1|GD832371
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|298182052|gb|HO026227.1|HO026227
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193674654|gb|FK618222.1|FK618222
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207732803|gb|GD712232.1|GD712232
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|16346985|gb|BI972580.1|BI972580
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193545109|gb|FK499878.1|FK499878
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|18735370|gb|BM528727.1|BM528727
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|7145629|gb|AW507551.1|AW507551
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193304461|gb|FK273108.1|FK273108
EST:     ATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTT-GTGTTCCTT
genomic: ATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAA-GTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTT
EST: gi|192325300|gb|FK019156.1|FK019156
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCTTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193640751|gb|FK588558.1|FK588558
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208111878|gb|GD911024.1|GD911024
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAG
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAG
EST: gi|193600908|gb|FK552979.1|FK552979
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCC
EST: gi|9259762|gb|BE347909.1|BE347909
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|298165322|gb|HO011371.1|HO011371
EST:     AATCGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|209699025|gb|BW664305.1|BW664305
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|4396115|gb|AI495112.1|AI495112
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208314684|gb|GE111304.1|GE111304
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193473359|gb|FK438712.1|FK438712
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTT
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTT
EST: gi|16996754|gb|BM086126.1|BM086126
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207693862|gb|GD674615.1|GD674615
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193370590|gb|FK334114.1|FK334114
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTG
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTG
EST: gi|207838682|gb|GD810400.1|GD810400
EST:     GTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193494887|gb|FK462273.1|FK462273
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|7283679|gb|AW596283.1|AW596283
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193623393|gb|FK574687.1|FK574687
EST:     CTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: CTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|209714152|gb|BW679481.1|BW679481
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|209720668|gb|BW654469.1|BW654469
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208172955|gb|GD972540.1|GD972540
EST:     GAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|8282599|gb|BE020160.1|BE020160
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208108895|gb|GD907607.1|GD907607
EST:     CTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: CTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207683771|gb|GD665074.1|GD665074
EST:     AAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCC-TTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: AAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|21637796|gb|BM107951.1|BM107951
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208084676|gb|GD881014.1|GD881014
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|21677020|gb|BQ629371.1|BQ629371
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193533106|gb|FK491036.1|FK491036
EST:     CTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTG
genomic: CTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCC-TCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTG
EST: gi|298191900|gb|HO035982.1|HO035982
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207838494|gb|GD812032.1|GD812032
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207819932|gb|GD789572.1|GD789572
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208147633|gb|GD944530.1|GD944530
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|7589997|gb|AW705759.1|AW705759
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208093398|gb|GD895237.1|GD895237
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTG
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTG
EST: gi|207829392|gb|GD803590.1|GD803590
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193330513|gb|FK292785.1|FK292785
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207726949|gb|GD702019.1|GD702019
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATG-GGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|9899377|gb|BE608345.1|BE608345
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|254316953|gb|GR828490.1|GR828490
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207799776|gb|GD768733.1|GD768733
EST:     GATTGTTACTAC-TTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207716097|gb|GD698467.1|GD698467
EST:     ATTGTTACTTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: ATTGTTAC-TACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207706102|gb|GD688438.1|GD688438
EST:     AGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: AGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193445653|gb|FK414900.1|FK414900
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATG-C-T-G                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTG
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTG
EST: gi|24136837|gb|BU927347.1|BU927347
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208264397|gb|GE064895.1|GE064895
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193334050|gb|FK297504.1|FK297504
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGACCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|209700974|gb|BW664155.1|BW664155
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193710821|gb|FK641778.1|FK641778
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208298256|gb|GE095445.1|GE095445
EST:     GATTGTTACTACTTTGGATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|18735501|gb|BM528799.1|BM528799
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|298170923|gb|HO015899.1|HO015899
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|193625307|gb|FK575181.1|FK575181
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTAGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTCGTTCCTT
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTT-GTTGTGAGCCCTCCTTTTGT-GTTCCTT
EST: gi|213601422|gb|DB968724.1|DB968724
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|207770169|gb|GD741391.1|GD741391
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|18735273|gb|BM528669.1|BM528669
EST:     GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: GATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
EST: gi|208127399|gb|GD925803.1|GD925803
EST:     AAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAG                         AAGTTGTTGTGAGCCCTCC-TTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC
genomic: AAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagactta ... acttttacagAAGTTGTTGTGAGCCCTCCTTTTGTGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGC

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
AATGGGACCACTGAGGAGGTAAAGAAGATTGTTACTACTTTGAATGAGGCTAAAGTCCCTGGAGAAGATGTCGTAGgtgagacttagctagcttctgatgggattgtctttttttgtggaaaacattttgtacttatcacacactcttgcgatggtctatctggctaagtaaattg

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG