Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|7232609|gb|AW567964.1|AW567964EST: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAG ACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
genomic: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAGgtacattctt ... ttttatccagACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
EST:
gi|6847826|gb|AW350116.1|AW350116EST: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAG ACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
genomic: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAGgtacattctt ... ttttatccagACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
EST:
gi|254336333|gb|GR842512.1|GR842512EST: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAG ACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
genomic: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAGgtacattctt ... ttttatccagACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
EST:
gi|51344024|gb|CO984757.1|CO984757EST: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAG ACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
genomic: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAGgtacattctt ... ttttatccagACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
EST:
gi|13252063|gb|BG362966.1|BG362966EST: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAG ACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
genomic: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAGgtacattctt ... ttttatccagACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
EST:
gi|9259773|gb|BE347920.1|BE347920EST: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAG ACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
genomic: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAGgtacattctt ... ttttatccagACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
EST:
gi|4314017|gb|AI461136.1|AI461136EST: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAG ACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
genomic: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAGgtacattctt ... ttttatccagACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
EST:
gi|37995084|gb|CF806673.1|CF806673EST: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAG ACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
genomic: TTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAGgtacattctt ... ttttatccagACGTTGGTTCGGTACCAGCTGCCTGTGGTCGTGATTGTTTTCAACAATGGT
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
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TCTTGGTTATTGTATTGCTGCCGCGGTTGCTTCGCCCGAGCGGCTTGTGGTTGCGGTTGAAGGGGATTCTGGATTTGGGTTTAGTGCTATGGAAGTTGAGgtacattcttgcttgactcgtgtcttgtgcattgtgcataataactacttagctgttcttgtgcaatgtgtgtgtgtgacattttttgtttatattcctg
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