Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCATGGCTGGACTTGCACCTGAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagattttttgtttttgtttttatctttcttctgagcaatctggttttattattactgaaacgttcttgttttgtgtcgaatatgattgcaacaggatgatgttaatgttatctgttaaattttaattaatggccttatcttcttttttttccctttcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA13G16570.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208120533|gb|GD915638.1|GD915638
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCCGATGGACAGGACTTCTTC
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTC
EST: gi|209702283|gb|BW677978.1|BW677978
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|213611789|gb|DB958883.1|DB958883
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|18848532|gb|BM567716.1|BM567716
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|192324821|gb|FK018797.1|FK018797
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|213599313|gb|DB962322.1|DB962322
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|209702379|gb|BW656354.1|BW656354
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|10846840|gb|BF071428.1|BF071428
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|213590331|gb|DB970129.1|DB970129
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|209710996|gb|BW681346.1|BW681346
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|213600814|gb|DB968820.1|DB968820
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|16349138|gb|BI974733.1|BI974733
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|213607320|gb|DB965150.1|DB965150
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: gi|7686567|gb|AW757215.1|AW757215
EST:     GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT                         ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA