1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
TGTGTCAAGGAGGGTAATGCAGCGTAGGTCTCGTATCCAGCAACAACAAGTGGTTCGAGAGGTTCTCCTGTCTATGCTTCCTCCAGGTGCGCCTGCCCAGgtggatcattttcactgatctattgcgtcactgcttttaatttctaatttatgatggtcaatagttaatagtgaaaatgataaagatgagttgatggctaacttgtgaacacatagtatatacatgcctgtatctgtgtgcaatttgagtcttttactgcatgtattgaattgaattagctatgttattgcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G10340.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGGTTCGAGAGGTTCTCCTGTCTATGCTTCCTCCAGGTGCGCCTGCCCAG TTCCGGAAATTGTTTCCGCCAACAAAATGGGCTGCAGAGTTTAATGCTGCAEST: gi|120529749|gb|EH257883.1|EH257883
genomic: TGGTTCGAGAGGTTCTCCTGTCTATGCTTCCTCCAGGTGCGCCTGCCCAGgtggatcatt ... gttattgcagTTCCGGAAATTGTTTCCGCCAACAAAATGGGCTGCAGAGTTTAATGCTGCA
EST: TGGTTCGAGAGGTTCTCCTGTCTATGCTTCCTCCAGGTGCGCCTGCCCAG TTCCG-AAATTGTTTCCGGCAACAEST: gi|193625334|gb|FK577434.1|FK577434
genomic: TGGTTCGAGAGGTTCTCCTGTCTATGCTTCCTCCAGGTGCGCCTGCCCAGgtggatcatt ... gttattgcagTTCCGGAAATTGTTTCCGCCAACA
EST: TGGTTCGAGAGGTTCTCCTGTCTATGCTTCCTCCAGGTGCGCCTGCCCAG TTCCGGAAATTGTTTCCGCCAACAAAATGGG
genomic: TGGTTCGAGAGGTTCTCCTGTCTATGCTTCCTCCAGGTGCGCCTGCCCAGgtggatcatt ... gttattgcagTTCCGGAAATTGTTTCCGCCAACAAAATGGG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGTGTCAAGGAGGGTAATGCAGCGTAGGTCTCGTATCCAGCAACAACAAGTGGTTCGAGAGGTTCTCCTGTCTATGCTTCCTCCAGGTGCGCCTGCCCAGgtggatcattttcactgatctattgcgtcactgcttttaatttctaatttatgatggtcaatagttaatagtgaaaatgataaagatgagttgatggctaacttgtgaacacatagtatatacatgcctgtatctgtgtgcaatttgagtcttttactgcatgtattgaattgaattagctatgttattgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGAGG