1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
AATTGGGAGACGTATTGCATTGGATTAGACAAGTGCTCGGCCTTGCGTGTGGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCTgtaagtgttttttttttctcccgggttagtatgtttatcttatagttgtatttgtatattgactgtaattcattgatcttgtgatattgcaattttgcaa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA11G14780.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCT CTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACTEST: gi|209706551|gb|BW667816.1|BW667816
genomic: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCTgtaagtgttt ... tgttttgtagCTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACT
EST: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCT CTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACTEST: gi|213589493|gb|DB973201.1|DB973201
genomic: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCTgtaagtgttt ... tgttttgtagCTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACT
EST: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCT CTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACTEST: gi|192320694|gb|FK012776.1|FK012776
genomic: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCTgtaagtgttt ... tgttttgtagCTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACT
EST: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATGTGGTTTATCCT CTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACTEST: gi|26058544|gb|CA801458.1|CA801458
genomic: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCTgtaagtgttt ... tgttttgtagCTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACT
EST: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCT CTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACTEST: gi|209712747|gb|BW681601.1|BW681601
genomic: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCTgtaagtgttt ... tgttttgtagCTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACT
EST: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCT CTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACTEST: gi|192320693|gb|FK012775.1|FK012775
genomic: GGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCTgtaagtgttt ... tgttttgtagCTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACT
EST: GGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATGTGGTTTATCCT CTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACT
genomic: GGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCTgtaagtgttt ... tgttttgtagCTTTTTAGCGTTATCCACTGGAATTATATATAGTTACTATGCAGTAATACT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AATTGGGAGACGTATTGCATTGGATTAGACAAGTGCTCGGCCTTGCGTGTGGATTCCTTTGGGGTTCCATACCTTTGGTTGGAGGCATATGGTTTATCCTgtaagtgttttttttttctcccgggttagtatgtttatcttatagttgtatttgtatattgactgtaattcattgatcttgtgatattgcaattttgcaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttctccc