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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TAATTATATTGCTCGAAATGATGACCACACCGGTCATCGAATGCTAAAGGACACTAAAACAATTGGATCTGCTTATGATCGGTACCTTCAAAGTGCAGGGgtagttaatcttaacctattttatttacataatatgtgaaaggatgtgctttcacagcttgtttgctgaaaactccctattttggttctgaagcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G37090.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298168716|gb|HO009646.1|HO009646
EST:     ACACTAAAACAATTGGATCTGCTTATGATCGGTACCTTCAAAGTGCAGGG                         CTTACTTCTTTTAATTCTGGGGAAGCCAGTGCGGTTGGCGGTGTTGGATTG
genomic: ACACTAAAACAATTGGATCTGCTTATGATCGGTACCTTCAAAGTGCAGGGgtagttaatc ... tctgaagcagCTTACTTCTTTTAATTCTGGGGAAGCCAGTGCGGTTGGCGGTGTTGGATTG
EST: gi|192297986|gb|FG993235.1|FG993235
EST:     ACACTAAAACAATTGGATCTGCTTATGATCGGTACCTTCAAAGTGCAAGG                         CTTACTTCTTTTAATTCTGGGGAAGCCAGTGCGGTTGGCGGTGTTGGATTG
genomic: ACACTAAAACAATTGGATCTGCTTATGATCGGTACCTTCAAAGTGCAGGGgtagttaatc ... tctgaagcagCTTACTTCTTTTAATTCTGGGGAAGCCAGTGCGGTTGGCGGTGTTGGATTG
EST: gi|22523059|gb|BU081870.1|BU081870
EST:     ACACTAAAACAATTGGATCTGCTTATGATCGGTACCTTCAAAGTGCAGGG                         CTTACTTCTTTTAATTCTGGGGAAGCCAGTGCGGTTGGCGGTGTTGGATTG
genomic: ACACTAAAACAATTGGATCTGCTTATGATCGGTACCTTCAAAGTGCAGGGgtagttaatc ... tctgaagcagCTTACTTCTTTTAATTCTGGGGAAGCCAGTGCGGTTGGCGGTGTTGGATTG
EST: gi|17020669|gb|BM091703.1|BM091703
EST:     ACACTAAAACAATTGGATCTGCTTATGATCGGTACCTTCAAAGTGCAGGG                         CTTACTTCTTTTAATTCTGGGGAAGCCAGTGCGGTTGGCGGTGTTGGATTG
genomic: ACACTAAAACAATTGGATCTGCTTATGATCGGTACCTTCAAAGTGCAGGGgtagttaatc ... tctgaagcagCTTACTTCTTTTAATTCTGGGGAAGCCAGTGCGGTTGGCGGTGTTGGATTG