1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
CTCCGCCACATCAATGTCGGTGAATTAGTCAAAGGAAAGAACTTGCATGATGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTGgtagatacatctttactttcttattttacacatctcaatttagaaaagccaattccttttgtggtgcaacaacatatggattttgatgaagttcttaagt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA10G33100.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTG GTCTGTGATGAACTTGAGGATGTTATGGAAGCGGGGGGAAACATTGTGGACEST: gi|254331788|gb|GR843638.1|GR843638
genomic: TGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTGgtagatacat ... atatctgtagGTCTGTGATGAACTTGAGGATGTTATGGAAGCGGGGGGAAACATTGTGGAC
EST: TGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTG GTCTGTGATGAACTTGAGGATGTTATGGAAGCGGGGGGAAACATTGTGGACEST: gi|254331789|gb|GR843639.1|GR843639
genomic: TGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTGgtagatacat ... atatctgtagGTCTGTGATGAACTTGAGGATGTTATGGAAGCGGGGGGAAACATTGTGGAC
EST: TGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTG GTCTGTGATGAACTTGAGGATGTTATGGAAGCGGGGGGAAACATTGTGGACEST: gi|17022576|gb|BM093610.1|BM093610
genomic: TGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTGgtagatacat ... atatctgtagGTCTGTGATGAACTTGAGGATGTTATGGAAGCGGGGGGAAACATTGTGGAC
EST: TGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTG GTCTGTGATGAACTTGAGGATGTTATGGAAGCGGGGGGAAACATTGTGGACEST: gi|298175481|gb|HO015114.1|HO015114
genomic: TGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTGgtagatacat ... atatctgtagGTCTGTGATGAACTTGAGGATGTTATGGAAGCGGGGGGAAACATTGTGGAC
EST: TGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTG GTCTGTGATGAACTTGAGGATGTTATGGAAGCGGGGGGAAACATTGTGGAC
genomic: TGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTGgtagatacat ... atatctgtagGTCTGTGATGAACTTGAGGATGTTATGGAAGCGGGGGGAAACATTGTGGAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTCCGCCACATCAATGTCGGTGAATTAGTCAAAGGAAAGAACTTGCATGATGGATGGATGGGATCTTGGGCTTCATTGTTATCTTCTTAATGAAGACTTGgtagatacatctttactttcttattttacacatctcaatttagaaaagccaattccttttgtggtgcaacaacatatggattttgatgaagttcttaagt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA