1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
AGCGACGTGGAGCACAAAACCGATGCCAAAAAGAAAGCGGTTCCTCGCAAAGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAGgtatgatcattatgattatgatgtactcattcctattcagtatttaattttatgtacattgaaaatttgcttgtgttgttaaagatcatctattattctt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA10G30900.2 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAG ATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGATGATGEST: gi|22523081|gb|BU081892.1|BU081892
genomic: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAGgtatgatcat ... ggatgattagATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGATGATG
EST: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAG ATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGATGATGEST: gi|254348659|gb|GR852338.1|GR852338
genomic: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAGgtatgatcat ... ggatgattagATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGATGATG
EST: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAG ATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGATGATGEST: gi|15664653|gb|BI702024.1|BI702024
genomic: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAGgtatgatcat ... ggatgattagATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGATGATG
EST: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAG ATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGATGATGEST: gi|208199976|gb|GE000428.1|GE000428
genomic: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAGgtatgatcat ... ggatgattagATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGATGATG
EST: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAG ATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGAEST: gi|6341837|gb|AW164661.1|AW164661
genomic: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAGgtatgatcat ... ggatgattagATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGA
EST: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAG ATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGATGATG
genomic: AGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAGgtatgatcat ... ggatgattagATGATTATCGGCTCTTCTGTGGGGATCTTGGTAACGAGGTGAATGATGATG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGCGACGTGGAGCACAAAACCGATGCCAAAAAGAAAGCGGTTCCTCGCAAAGCTGCTGGCCACGCTTGGGAGGATCCTATCCTTGCAGAGTGGCCAGAAGgtatgatcattatgattatgatgtactcattcctattcagtatttaattttatgtacattgaaaatttgcttgtgttgttaaagatcatctattattctt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT