Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATTAAATTGGATTTTGATTATTCATGGCTGAACAAGCATTGGAAGGTAGCCAACCTGTGGATTTAACAAAGCACCCTTCTGGGATTGTGCCTACCCTTCAgtgagtatcacttgtcttttaagttaatgcttctttggattgtaattaagagcatgaaatgggtaactgtgttgtttgcaacaatgtgttgtagtttgaa...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA09G41330.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|254336235|gb|GR842414.1|GR842414
EST:     CAACCTGTGGATTTAACAAAGCACCCTTCTGGGATTGTGCCTACCCTTCA                         AAATATTGTGTCAACGGTCAATTTGGACTGTAAATTGGAGCTTAAATCAAT
genomic: CAACCTGTGGATTTAACAAAGCACCCTTCTGGGATTGTGCCTACCCTTCAgtgagtatca ... atactgccagAAATATTGTGTCAACGGTCAATTTGGACTGTAAGTTGGAGCTTAAATCAAT
EST: gi|19270744|gb|BM887000.1|BM887000
EST:     ATTTAACAAAGCACCCTTCTGGGATTGTGCCTACCCTTCA                         AAATATTGTGTCAACGGTCAATTTGGACTGTAAATTGGAGCTTAAATCAAT
genomic: ATTTAACAAAGCACCCTTCTGGGATTGTGCCTACCCTTCAgtgagtatca ... atactgccagAAATATTGTGTCAACGGTCAATTTGGACTGTAAGTTGGAGCTTAAATCAAT
EST: gi|21887668|gb|BQ740881.1|BQ740881
EST:     CAACCTGTGGATTTAACAAAGCACCCTTCTGGGATTGTGCCTACCCTTCA                         AAATATTGTGTCAACGGTCAATTTGGACTGTAAATTGGAGCTTAAATCAAT
genomic: CAACCTGTGGATTTAACAAAGCACCCTTCTGGGATTGTGCCTACCCTTCAgtgagtatca ... atactgccagAAATATTGTGTCAACGGTCAATTTGGACTGTAAGTTGGAGCTTAAATCAAT