Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCTTCCATTCATTAAAGTTTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAGgtgagaatatttcaatgcatcaatcattcataatctttattgttatgctcattataagttgaaatcctcgggcctttcacctgttttctctgataagttg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA09G40970.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|15201232|gb|BI424764.1|BI424764
EST:     TTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAG                         AATCATGCTAAGGATAATGATTCTGATCATGATGTGGATTTTGCTGCTGGG
genomic: TTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAGgtgagaatat ... atgcttgtagAATCATGCTAAGGATAATGATTCTGATCATGATGTGGATTTTGCTGCTGGG
EST: gi|15203337|gb|BI426105.1|BI426105
EST:     TTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAG                         AATCATGCTAAGGATAATGATTCTGATCATGATGTGGATTTTGCTGCTGGG
genomic: TTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAGgtgagaatat ... atgcttgtagAATCATGCTAAGGATAATGATTCTGATCATGATGTGGATTTTGCTGCTGGG
EST: gi|7478449|gb|AW666269.1|AW666269
EST:     TTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAG                         AATCATGCTAAGGATAATGATTCTGATCATGATGTGGATTTTGCTGCTGGG
genomic: TTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAGgtgagaatat ... atgcttgtagAATCATGCTAAGGATAATGATTCTGATCATGATGTGGATTTTGCTGCTGGG
EST: gi|21257008|gb|BQ453896.1|BQ453896
EST:     TTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAG                         AATCATGCTAAGGATAATGATTCTGATCATGATGTGGATTTTGCTGCTGGG
genomic: TTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAGgtgagaatat ... atgcttgtagAATCATGCTAAGGATAATGATTCTGATCATGATGTGGATTTTGCTGCTGGG
EST: gi|13790090|gb|BG652681.1|BG652681
EST:     TTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAG                         AATCATGCTAAGGATAATGATTCTGATCATGATGTGGATTTTGCTGCTGGG
genomic: TTACAAGTTTGCGGCTTTCAAACGATTATATGGGGAGTTGTGTGTCTAAGgtgagaatat ... atgcttgtagAATCATGCTAAGGATAATGATTCTGATCATGATGTGGATTTTGCTGCTGGG