1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
CTCTGTTGACATGTGGTCTTTCGCTTGCATTGCTTTTGAGCTTGCCACTGGTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAGgtatgttgattttgtttgtacactattattatttaaattatgttccgcatcttctatgaatggatgacagtgtttatgataatgagtccatttgaagtca...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA09G33020.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAG GATCACCTTGCCCTGATGATGGAACTCCTTGGAAAGATGCCCCGGAAGEST: gi|192319502|gb|FK009484.1|FK009484
genomic: GTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAGgtatgttgat ... ttggtttcagGATCACCTTGCCCTGATGATGGAACTCCTTGGAAAGATGCCCCGGAAG
EST: GTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAG GATCACCTTGCCCTGATGATGGAACTCCTTGGAAAGATGCCCCEST: gi|192311967|gb|FK004248.1|FK004248
genomic: GTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAGgtatgttgat ... ttggtttcagGATCACCTTGCCCTGATGATGGAACTCCTTGGAAAGATGCCCC
EST: GTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAG GATCACCTTGCCCTGATGATGGAACTCCTTGGAAAGATGCCCCGGAAGEST: gi|192319503|gb|FK009485.1|FK009485
genomic: GTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAGgtatgttgat ... ttggtttcagGATCACCTTGCCCTGATGATGGAACTCCTTGGAAAGATGCCCCGGAAG
EST: GTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAG GATCACCTTGCCCTGATGATGGAACTCCTTGGAAAGATGCCCCGGAAGEST: gi|192311966|gb|FK004247.1|FK004247
genomic: GTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAGgtatgttgat ... ttggtttcagGATCACCTTGCCCTGATGATGGAACTCCTTGGAAAGATGCCCCGGAAG
EST: GTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAG GATCACCTTGCCCTGATGATGGAACTCCTTGGAAAGATGCCCCGGAAG
genomic: GTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAGgtatgttgat ... ttggtttcagGATCACCTTGCCCTGATGATGGAACTCCTTGGAAAGATGCCCCGGAAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTCTGTTGACATGTGGTCTTTCGCTTGCATTGCTTTTGAGCTTGCCACTGGTGATATGCTATTTACTCCCAAGGATGGACAAGGTTTTAGTGAGGATGAGgtatgttgattttgtttgtacactattattatttaaattatgttccgcatcttctatgaatggatgacagtgtttatgataatgagtccatttgaagtca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG