1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GACCACTTGGATGGAGCCTGAGTGTGACAAGCTCATAATGGCTTCACTTAACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAGgtctgtctgtgtgtcacttctctctcttccttgagtattttggtgtctttattatatctgattatgacatttaggtccttgaagttcggtctgtcaaaaa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA09G29900.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAG AACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAAEST: gi|208250500|gb|GE044695.1|GE044695
genomic: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAGgtctgtctgt ... aattctgcagAACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAA
EST: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAG AACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAAEST: gi|213613693|gb|DB963339.1|DB963339
genomic: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAGgtctgtctgt ... aattctgcagAACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAA
EST: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAG AACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAAEST: gi|213599934|gb|DB973936.1|DB973936
genomic: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAGgtctgtctgt ... aattctgcagAACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAA
EST: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAG AACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAAEST: gi|23726499|gb|BU761243.1|BU761243
genomic: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAGgtctgtctgt ... aattctgcagAACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAA
EST: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAG AACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAAEST: gi|209697318|gb|BW655559.1|BW655559
genomic: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAGgtctgtctgt ... aattctgcagAACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAA
EST: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAG AACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAA
genomic: ACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAGgtctgtctgt ... aattctgcagAACCGTTGTGTTAATATAATAGCAAATCTATTCCATGCTCCTATAAGTGAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GACCACTTGGATGGAGCCTGAGTGTGACAAGCTCATAATGGCTTCACTTAACAAAAACTATGTTGATATGGATGAGTATCCTGTCACCACTGAGCTCCAGgtctgtctgtgtgtcacttctctctcttccttgagtattttggtgtctttattatatctgattatgacatttaggtccttgaagttcggtctgtcaaaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctctctc