1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
ATCGGTTTATATTGTATACACAGTGCTTGGCGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCTgtatgtatttatggaatcagtattttatatttgttgatttgattgtaaaataaaagtatggaaatgagtaatttcagatgctttgcagcggataggctcc...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G22580.2 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCT TGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGAEST: gi|15815415|gb|BI787690.1|BI787690
genomic: CGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCTgtatgtattt ... ttttctctagTGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGA
EST: CGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCT TGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGAEST: gi|208112989|gb|GD910628.1|GD910628
genomic: CGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCTgtatgtattt ... ttttctctagTGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGA
EST: GATGTTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCT TGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGAEST: gi|254314950|gb|GR829943.1|GR829943
genomic: GATG-TCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCTgtatgtattt ... ttttctctagTGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGA
EST: GACGAACTTGCCT TGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGAEST: gi|20813268|gb|BQ297746.1|BQ297746
genomic: GACGAACTTGCCTgtatgtattt ... ttttctctagTGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGA
EST: GTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCT TGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGAEST: gi|41146511|gb|CK606722.1|CK606722
genomic: GTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCTgtatgtattt ... ttttctctagTGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGA
EST: CGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCT TGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGAEST: gi|208230035|gb|GE023390.1|GE023390
genomic: CGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCTgtatgtattt ... ttttctctagTGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGA
EST: CGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCT TGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGAEST: gi|208263701|gb|GE062869.1|GE062869
genomic: CGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCTgtatgtattt ... ttttctctagTGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGA
EST: CGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCT TGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGA
genomic: CGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCTgtatgtattt ... ttttctctagTGTCCGAAGTGATCTTTGTGATAACCTCAGCTGTGAAGGATGTATGTGGGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATCGGTTTATATTGTATACACAGTGCTTGGCGATGTCAGCATCTATGTCGTGGGCAAGGATGAGTATGACGAACTTGCCTgtatgtatttatggaatcagtattttatatttgttgatttgattgtaaaataaaagtatggaaatgagtaatttcagatgctttgcagcggataggctcc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaaataaa