Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   		26  
 5'  3'   		27  
 5'  3'   		28  
 5'  3'   		29  
 5'  3'   		30  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATTTGACGCTAGTCACAAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAGgtatgtatacacatgttctgatgttcatatgcattgtggctgttcatgatgaatggttttcgatttcttcgcgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA07G40230.2
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|213610988|gb|DB970915.1|DB970915
EST:     AAACTTGTGGAAACATGTACAACCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAG                         ATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATATGGCCACATCTGATTTGCTC
genomic: AAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAGgtatgtatac ... cttcgcgcagATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATATGGCCACATCTGATTTGCTC
EST: gi|208148790|gb|GD945436.1|GD945436
EST:     AAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAG                         ATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATAT
genomic: AAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAGgtatgtatac ... cttcgcgcagATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATAT
EST: gi|213600096|gb|DB964302.1|DB964302
EST:     AAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAG                         ATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATATGGCCACATCTGATTTGCTC
genomic: AAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAGgtatgtatac ... cttcgcgcagATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATATGGCCACATCTGATTTGCTC
EST: gi|213613547|gb|DB963263.1|DB963263
EST:     AAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAG                         ATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATATGGCCACATCTGATTTGCTC
genomic: AAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAGgtatgtatac ... cttcgcgcagATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATATGGCCACATCTGATTTGCTC
EST: gi|209717236|gb|BW657705.1|BW657705
EST:     AAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAG                         ATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATATGGCCACATCTGATTTGCTC
genomic: AAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAGgtatgtatac ... cttcgcgcagATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATATGGCCACATCTGATTTGCTC
EST: gi|213619876|gb|DB971135.1|DB971135
EST:     AAACTTGTGGAAACATGGCCAACCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAG                         ATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATATGGCCACATCTGATTTGCTC
genomic: AAACTTGTGGAAACATGGCCAATCTAGCTTTGACTAGCATACTAGAAAAGgtatgtatac ... cttcgcgcagATGACTGGGAAGGACAAAGATTACAGATATATGGCCACATCTGATTTGCTC