1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
GGACCAACCTCTGTTATTGTATTCTTATGCTATATATTGCAGTCGAGCATTTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAGgtatgctcgttagctggaaatcttattatatctgtgtctgttcctattttttgtggagcattaagaaatgatctattaacctctataactttgccactgaag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA07G31840.3 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAG GAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGAEST: gi|208239627|gb|GE036697.1|GE036697
genomic: TTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAGgtatgctcgt ... gccactgaagGAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGA
EST: TTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAG GAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGAEST: gi|7692658|gb|AW760759.1|AW760759
genomic: TTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAGgtatgctcgt ... gccactgaagGAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGA
EST: CTTGGTGATGCTCTGGGTGAG GAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGAEST: gi|6916434|gb|AW397964.1|AW397964
genomic: CTTGGTGATGCTCTGGGTGAGgtatgctcgt ... gccactgaagGAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGA
EST: TTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAG GAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGAEST: gi|208284798|gb|GE085612.1|GE085612
genomic: TTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAGgtatgctcgt ... gccactgaagGAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGA
EST: TTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAG GAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAGGGAEST: gi|151395160|gb|EV265031.1|EV265031
genomic: TTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAGgtatgctcgt ... gccactgaagGAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGA
EST: ATGCTCTGGGTGAG GAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGAEST: gi|16997201|gb|BM086573.1|BM086573
genomic: ATGCTCTGGGTGAGgtatgctcgt ... gccactgaagGAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGA
EST: TTGGTGATGCTCTGGGTGAG GAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGAEST: gi|8825892|gb|BE209622.1|BE209622
genomic: TTGGTGATGCTCTGGGTGAGgtatgctcgt ... gccactgaagGAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGA
EST: TTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAG GAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGA
genomic: TTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAGgtatgctcgt ... gccactgaagGAGTTTAAAGGATATGTTTTCAAAATCACCGGTGGGTGTGACAAACAAGGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGACCAACCTCTGTTATTGTATTCTTATGCTATATATTGCAGTCGAGCATTTTGGGACAAGAGGATCTCCCAGGAGGTTCTTGGTGATGCTCTGGGTGAGgtatgctcgttagctggaaatcttattatatctgtgtctgttcctattttttgtggagcattaagaaatgatctattaacctctataactttgccactgaag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT