Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcacacagtacatgctaacaacttgtgctttttaaaggattaactgtgcttttagttctgaaaattttctgaagttttggttttagttcctgat...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA06G20570.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|209727462|gb|BW651957.1|BW651957
EST:     GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|298187817|gb|HO031774.1|HO031774
EST:     GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|208325936|gb|GE121900.1|GE121900
EST:     TTGCTGGGCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: TTGCTGGGCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|298168324|gb|HO014499.1|HO014499
EST:     GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|192326557|gb|FK018834.1|FK018834
EST:     GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|298168765|gb|HO009695.1|HO009695
EST:     GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|207769797|gb|GD741789.1|GD741789
EST:     CTTGCTGGGCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: CTTGCTGGGCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|26045617|gb|CA783151.1|CA783151
EST:     GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|193419106|gb|FK382280.1|FK382280
EST:     GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|192310282|gb|FK002610.1|FK002610
EST:     GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|6667545|gb|AW278996.1|AW278996
EST:     GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: gi|192310283|gb|FK002611.1|FK002611
EST:     GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT                         ATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTGTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcctcagATATGCCTCAGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA