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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAGTGTATGTTGCCAACCGAGCATCGGACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttctttctatcccatcaattttgtgtagatgtccaaattttgtgaaattatggtgatttgttcctatcattattattagcctggagttgatttc...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA06G08260.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA06G08260.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os06g04800.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
GAGTGTATGTTGCCAACCGAGCATCGGACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttctttctatcccatcaattttgtgtagatgtccaaattttgtgaaattatggtg--atttgttcctatcattattattagcctggagttgatttc
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GAATGTATGTGGCGAACCGTGCATCTGACAAAATTACTCAACTGACTGACAATGTGTACGTCTGCCGCTCTGGATCTgtaa-gtgcctacattgtttagagtcttgggcccccttctttatgttgttgcttcgtgttattattatatgctgtaaaaaacatactctcttcattaagca-

upper sequence: GLYMA06G08260.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: Vv04s0008g02850.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 2
GAGTGTATGTTGCCAACCGAGCATCGGACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttctttctatcccatcaattttgtgtagatgtccaaattttgtgaaattatggtgatttgttcctatcatt-attattagcctggag-----ttgatttc--
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GAATGTATGTCGCTAACAGAGCATCGGACAAAATCACACAGCTGACAGATAATGTCTACATTTGTCGCTCTGGATCGgtactcctcttttcgaatcattaacttgcccta------cagctgtgattgaatcgt--ttaactctctataacattgagaattgatctaaaacatgtttaatttcat
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298196281|gb|HO044672.1|HO044672
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|192293857|gb|FG986066.1|FG986066
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|254326872|gb|GR836481.1|GR836481
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|151403047|gb|EV272860.1|EV272860
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|120529083|gb|EH257217.1|EH257217
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|151400109|gb|EV269923.1|EV269923
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|7587840|gb|AW703648.1|AW703648
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|151393354|gb|EV263229.1|EV263229
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|151405592|gb|EV275406.1|EV275406
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|298163452|gb|HO012185.1|HO012185
EST:     ACAAGATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|298186101|gb|HO036734.1|HO036734
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|192327794|gb|FK022073.1|FK022073
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|308098837|gb|HO760678.1|HO760678
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAG
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|27424900|gb|CA936420.1|CA936420
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|15337215|gb|BI497871.1|BI497871
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|13478110|gb|BG507722.1|BG507722
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|16997060|gb|BM086432.1|BM086432
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|192333616|gb|FK025433.1|FK025433
EST:     TCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: TCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|27427298|gb|CA938818.1|CA938818
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|192333615|gb|FK025432.1|FK025432
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|10231723|gb|BE800611.1|BE800611
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|15815710|gb|BI787985.1|BI787985
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|254321189|gb|GR827638.1|GR827638
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|58017005|gb|CX703747.1|CX703747
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|24205242|gb|BU964495.1|BU964495
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|298198461|gb|HO040000.1|HO040000
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|298198235|gb|HO039774.1|HO039774
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGCCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|16105248|gb|BI892988.1|BI892988
EST:     ACAAATTTTCTCAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|254326873|gb|GR836482.1|GR836482
EST:     GCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGA-TGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: GCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|57575063|gb|CX548038.1|CX548038
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|298191590|gb|HO039069.1|HO039069
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|10237932|gb|BE806820.1|BE806820
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|192310604|gb|FG999249.1|FG999249
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATATGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|6455701|gb|AW186384.1|AW186384
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|4405614|gb|AI507763.1|AI507763
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|15814454|gb|BI786729.1|BI786729
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|14516465|gb|BI095137.1|BI095137
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|7639793|gb|AW734108.1|AW734108
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|298195881|gb|HO044272.1|HO044272
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|13478005|gb|BG507655.1|BG507655
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|19347226|gb|BM892106.1|BM892106
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
EST: gi|37995371|gb|CF806960.1|CF806960
EST:     ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCG                         GCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA
genomic: ACAAAATCACACAGCTCACTGATAATGTTTACGTGTGTCGCTCTGGATCGgtattgttct ... ctttttacagGCTGCTGATTCTCAGATTGTCTCTGACTATGTGCGCTACTTCCTTCACCAA

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
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