Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGGAACTGTTGTTTGGTGGAACAGACGTGCCCGCAATGATGAAGTGTTTCTCGGTGTCCTTATCCTCTTTATGGGTTCTCCTTGCTCTCTGTTCTCTGAGgtatgcagccatggaatcttttacttctcttgctattgttttgttgattctgagtttcgcttgtgtagtcctttatgctacattttggatatttgttaag...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA05G30770.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|213593299|gb|DB973548.1|DB973548
EST:     TCGGTGTCCTTATCCTCTTTATGGGTTCTCCTTGCTCTCTGTTCTCTGAG                         TGTGTTATCGCAAAATATATCTCAGAGTGGCCTACAGCAAGCTAGCCTCCC
genomic: TCGGTGTCCTTATCCTCTTTATGGGTTCTCCTTGCTCTCTGTTCTCTGAGgtatgcagcc ... gtcatttcagTGTGTTATCGCAAAATATATCTCAGAGTGGCCTACAGCAAGCTAGCCTCCC
EST: gi|151393893|gb|EV263764.1|EV263764
EST:     TCGGTGTCCTTATCCTCTTTATGGGTTCTCCTTGCTCTCTGTTCTCTGAG                         TGTGTTATCGCAAAATATATCTCAGAGTGGCCTACAGCAAGCTAGCCTCCC
genomic: TCGGTGTCCTTATCCTCTTTATGGGTTCTCCTTGCTCTCTGTTCTCTGAGgtatgcagcc ... gtcatttcagTGTGTTATCGCAAAATATATCTCAGAGTGGCCTACAGCAAGCTAGCCTCCC
EST: gi|213599299|gb|DB960039.1|DB960039
EST:     TCGGTGTCCTTATCCTCTTTATGGGTTCTCCTTGCTCTCTGTTCTCTGAG                         TGTGTTATCGCAAAATATATCTCAGAGTGGCCTACAGCAAGCTAGCCTCCC
genomic: TCGGTGTCCTTATCCTCTTTATGGGTTCTCCTTGCTCTCTGTTCTCTGAGgtatgcagcc ... gtcatttcagTGTGTTATCGCAAAATATATCTCAGAGTGGCCTACAGCAAGCTAGCCTCCC