1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcacacagtacatgttaacaactttttttaaaaaaagattaactgtgtttttagttctgcaaaattttctgaagtttggttttagttcctgatt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G33880.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT ATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCAEST: gi|298190156|gb|HO032277.1|HO032277
genomic: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcttcagATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT ATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCAEST: gi|208224477|gb|GE021844.1|GE021844
genomic: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcttcagATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT ATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCAEST: gi|207836568|gb|GD806565.1|GD806565
genomic: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcttcagATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT ATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGAEST: gi|298176531|gb|HO023118.1|HO023118
genomic: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcttcagATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGA
EST: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCT ATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGGCCAGCAEST: gi|298181555|gb|HO025730.1|HO025730
genomic: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcttcagATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
EST: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCCATCCTCT ATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
genomic: GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcac ... aatgcttcagATATGCCTCGGTTAGGGCAATTGAGAGCAAGTCTCCTGTTGATGACCAGCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GCCTTTGCTTAGTCTTGCCTATCCTCTgtaagtgcacacagtacatgttaacaactttttttaaaaaaagattaactgtgtttttagttctgcaaaattttctgaagtttggttttagttcctgatt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - taaaaaaa