Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTTATTGCCAAGTGTTTGAATAAGAACATGGGCGTGGACAATAATTTGCTTGCCAAACCTAGAAGGCGTGCTAATTTTCGGTTATGCAATGTGTCATGgtatgtaatgtaatctcgaaccttgaatttgacgacgattttgtttatttatttatttatgtatttattcgtttcatcatttatgtgtactttttgtttag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA03G35830.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192314238|gb|FK006976.1|FK006976
EST:     CTTGCCAAACCTAGAAGGCGTGCTAATTTTCGGTTATGCAATGTGTCATG                         TTACACTTCTGAAGTATTGGAGATTCAATCTGATGCTCCTACACTGCATGT
genomic: CTTGCCAAACCTAGAAGGCGTGCTAATTTTCGGTTATGCAATGTGTCATGgtatgtaatg ... ttttgtttagTTACACTTCTGAAGTATTGGAGATTCAATCTGATGCTCCTACACTGCATGT
EST: gi|192314239|gb|FK006977.1|FK006977
EST:     CTTGCCAAACCTAGAAGGCGTGCTAATTTTCGGTTATGCAATGTGTCATG                         TTACACTTCTGAAGTATTGGAGATTCAATCTGATGCTCCTACACTGCATGT
genomic: CTTGCCAAACCTAGAAGGCGTGCTAATTTTCGGTTATGCAATGTGTCATGgtatgtaatg ... ttttgtttagTTACACTTCTGAAGTATTGGAGATTCAATCTGATGCTCCTACACTGCATGT
EST: gi|6134681|gb|AW133074.1|AW133074
EST:     CTTGCCAAACCTAGAAGGCGTGCTAATTTTCGGTTATGCAATGTGTCATG                         TTACACTTCTGAAGTATTGGAGATTCAATCTGATGCTTCTACACTGCATGT
genomic: CTTGCCAAACCTAGAAGGCGTGCTAATTTTCGGTTATGCAATGTGTCATGgtatgtaatg ... ttttgtttagTTACACTTCTGAAGTATTGGAGATTCAATCTGATGCTCCTACACTGCATGT
EST: gi|151395111|gb|EV264982.1|EV264982
EST:     CTTGCCAAACCTAGAAGGCGTGCTAATTTTCGGTTATGCAATGTGTCATG                         TTACACTTCTGAAGTATTGGAGATTCAATCTGATGCTCCTACACTGCATGT
genomic: CTTGCCAAACCTAGAAGGCGTGCTAATTTTCGGTTATGCAATGTGTCATGgtatgtaatg ... ttttgtttagTTACACTTCTGAAGTATTGGAGATTCAATCTGATGCTCCTACACTGCATGT