1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
ATCTGTGCTTGAACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttctgttttctctgctttcacttcacactcgcacgtcgtcgtttcacttgcgttttcgtgtcggatttgttctggttccgttcgtgagcccgat...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA03G33000.7 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|193489536|gb|FK456295.1|FK456295
genomic: AGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|7925031|gb|AW831057.1|AW831057
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|207800405|gb|GD775410.1|GD775410
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATTTGGATGCCGAAACTEST: gi|193561881|gb|FK516858.1|FK516858
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTG-AACCGNTATGGATGCCGAAACTEST: gi|193709781|gb|FK646049.1|FK646049
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|193722890|gb|FK657466.1|FK657466
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|208022972|gb|GD820982.1|GD820982
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|193656797|gb|FK606713.1|FK606713
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: AGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|193677865|gb|FK614979.1|FK614979
genomic: AGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTCGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|24136670|gb|BU927180.1|BU927180
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|193683993|gb|FK621451.1|FK621451
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTCGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|5510301|gb|AI856743.1|AI856743
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: GCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|193558208|gb|FK513333.1|FK513333
genomic: GCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|193583266|gb|FK538844.1|FK538844
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|9986811|gb|BE660919.1|BE660919
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: AGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|193706053|gb|FK648477.1|FK648477
genomic: AGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|193563220|gb|FK520339.1|FK520339
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG -AGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTEST: gi|208064662|gb|GD865938.1|GD865938
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
EST: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTGTTGCEST: gi|298199436|gb|HO042799.1|HO042799
genomic: ACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACTGTTGC
EST: AGACGAGCTTCACCTTGCGCTG AAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
genomic: AGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttct ... gctgtttcagAAGGGCCACAGATGGTTGAAACCGATATGGATGCCGAAACT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATCTGTGCTTGAACCTTCACTTGTGTTTCCTTCCTTCTGCAGACGAGCTTCACCTTGCGCCGgtgagtttctgttttctctgctttcacttcacactcgcacgtcgtcgtttcacttgcgttttcgtgtcggatttgttctggttccgttcgtgagcccgat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGCAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCTT