1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
AATTGCTTTGCTGGTTACTTTCTTGGTGGGTTGTGTCAGCCTGGCTTTATAATCCCCCCTATGGATTCTGTGATCTTATTTGGAGATGGAAACGTAAAGGgtaagtgaactgatctttatgtcctataaatgttttatgactcttctgaattcttgaaactgttccacacaatttgtttgaactatatatgtgcatctcttgaatttggcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA0317S00200.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AATCCCCCCTATGGATTCTGTGATCTTATTTGGAGATGGAAACGTAAAGG CTATCTATGTGGATGAAGATGATATAGCTATGTACACTATCAAAACCATAGEST: gi|151412917|gb|EV282729.1|EV282729
genomic: AATCCCCCCTATGGATTCTGTGATCTTATTTGGAGATGGAAACGTAAAGGgtaagtgaac ... aatttggcagCTATCTATGTGGATGAAGATGATATAGCTATGTACACTATCAAAACCATAG
EST: AATCCCCCCTATGGATTCTGTGATCTTATTTGGAGATGGAAACGTAAAGG CTATCTATGTGGATGAAGATGATATAGCTATGTACACTATCAAAACCATAG
genomic: AATCCCCCCTATGGATTCTGTGATCTTATTTGGAGATGGAAACGTAAAGGgtaagtgaac ... aatttggcagCTATCTATGTGGATGAAGATGATATAGCTATGTACACTATCAAAACCATAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AATTGCTTTGCTGGTTACTTTCTTGGTGGGTTGTGTCAGCCTGGCTTTATAATCCCCCCTATGGATTCTGTGATCTTATTTGGAGATGGAAACGTAAAGGgtaagtgaactgatctttatgtcctataaatgttttatgactcttctgaattcttgaaactgttccacacaatttgtttgaactatatatgtgcatctcttgaatttggcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA