1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
AATGGCCATGTTGGATTTATGTTGTCATGCTATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAGgtaatttaattggacatgattcttggtgaatatattatgttcccatcagtcattgaaagaagaaatattaaaaattaactgagcccattttcattatatc...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA02G44660.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAG ATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATGEST: gi|58021523|gb|CX708264.1|CX708264
genomic: TATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAGgtaatttaat ... cttattacagATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATG
EST: TATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTNCAGGCCAG ATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATGEST: gi|58024547|gb|CX711288.1|CX711288
genomic: TATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAGgtaatttaat ... cttattacagATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATG
EST: TATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAG ATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATGEST: gi|19053546|gb|BM732213.1|BM732213
genomic: TATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAGgtaatttaat ... cttattacagATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATG
EST: ATGATGCTGAGAAATAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAG ATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATGEST: gi|6482324|gb|AW201591.1|AW201591
genomic: ATGATGCTGAG-CTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAGgtaatttaat ... cttattacagATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATG
EST: TATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAG ATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATGEST: gi|57575974|gb|CX548945.1|CX548945
genomic: TATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAGgtaatttaat ... cttattacagATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATG
EST: TATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAG ATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATG
genomic: TATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAGgtaatttaat ... cttattacagATATCCACCACATGGAAGAAGGGCAGTTGCAGTAGAGCATGGCATTCCATG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AATGGCCATGTTGGATTTATGTTGTCATGCTATGATGCTGAGCTTAGCTATGATCCTCACACTGACACCTTCCAGGCCAGgtaatttaattggacatgattcttggtgaatatattatgttcccatcagtcattgaaagaagaaatattaaaaattaactgagcccattttcattatatc
- - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -agaagaaa