Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttattgtattacttctgttgaaattgaaatttggttgtgaatcatgtgttgatttggtaaaagcttgtcatggtgtttcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA01G41620.3
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA01G41620.3 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os05g19370.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgtt--attgtatta--cttctgttgaaattg--------aaatttggttgtgaatcatgtgttgatttggtaaaagcttgtcatggtgtttcag
||| || || || ||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| | || ||| | | | || ||| || || || | || |||| || |||| | | ||| | | |||
CCAGCTCAAGTTCCAGAGGAACAAGAGGTCAGTTGCTGAGGAGAGAGCTGGACGCAAGCTGGGTGGACTCAGGGTGCTCAACTCCTACTGGGTGAATGAGgtatatttgatttcactgggatcttgcggaagatggcaaaaaaaatttcagctgcttttcattaattcctttgttttca--ttggcttaatgtag---

upper sequence: GLYMA01G41620.3 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os03g40180.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgtt--attgtatt-acttctgttgaaattgaaatttggttgtgaatcatgtgttgatttggtaaa--agcttgtcatggtgt--ttcag
||| || || || ||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || | | || | | ||| | || ||| | || ||| || || || | | | || |||| | | |||
CCAGCTCAAGTTCCAGAGGAACAAGAGGTCAGTTGCTGAGGAGAGAGCTGGGCGCAAGTTGGGCGGACTCAGGGTGCTCAACTCCTACTGGGTGAACGAGgtacatttcactttactgagatctttcaaagatgattatcaacaatgtatc-tgccttccattaatgacttggttttctttggtttaatgcag

upper sequence: GLYMA01G41620.3 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM2G034794_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 1
CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgtt--attgtattacttctgttgaaat----tga-aatttggttgtgaatcatgtgttgatttggta---aaagcttgtcatggtgtttcag
||| || || || ||| | | ||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || | |||| || | | || ||| ||||| | ||| || |||| | ||||| | | |||
CCAGCTCAAGTTCCAGAGGAACAAGAGGTCTGTTGCTGAGGAGAGGGCTGGACGAAAGCTTGGTGGACTCAGGGTTCTCAACTCCTACTGGGTGAATGAGgtatgcttaattgagttgagcttaacaagatatcatgagaattttcatccttgtca-gtactgatgccacatctggctcttgttactggacaacag

upper sequence: GLYMA01G41620.3 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM2G180724_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttg-ttattgtatt-acttctgttgaaattgaaatttggt----tgtgaatcatgtgttgatttggta---aaagcttgtcatggtgtttcag--------
||| || || || ||| | | ||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| | || | || | || || || || || | | || |||| | | || ||| | ||| || |||| | |
CCAGCTCAAGTTCCAGAGGAACAAGAGGTCTGTTGCTGAGGAGAGGGCTGGACGAAAGCTTGGTGGACTCAGGGTTCTCAACTCCTACTGGGTGAATGAGgtatacttgaaatcttgaattgtgccgagcttataacaagatagcatgagaattttcatcctagttagtactgatgccttatctccttgttactgaacaacag

upper sequence: GLYMA01G41620.3 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM2G024354_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgtt--attgta------ttacttctgttgaaattga--aatttggttgtgaatcatgtgttgatttggtaaaagcttgtcatg---gtgtttcag-------
||| || || || ||| | | ||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| | |||||| ||| || || ||| | | ||| || | | || ||| ||| || || |||| | | ||
CCAGCTCAAGTTCCAGAGGAACAAGAGGTCTGTCGCTGAGGAGAGAGCTGGACGTAAGCTTGGTGGACTGAGGGTTCTTAACTCCTACTGGGTGAATGAGgtacatcggattgtaacatgaacactcctctttaaacatactagcttgtttatatctgtcaaattttttttctaattgcctgacatgcccatatctcctatcacag

upper sequence: GLYMA01G41620.3 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM2G084757_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 2
CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttattgtatt-acttctgttgaaattgaaatttggttgtgaatcatgtgttgatt--tggtaaaagcttgtcatggtgtttcag-----------
||| || || || ||| | | |||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| | | || ||| | | | | | | | || | || | | | || | | | ||| || | | ||
CCAGCTCAAGTTCCAGAGGAACAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGGGCTGGACGAAAGCTTGGTGGACTCAGGGTTCTCAACTCCTACTGGGTGAATGAGgtatact--tgaattgagtcgagattataacaagatagcatgaggattttcatcctagttagtactgatgccttatctcgctcttgttactgaacaacag

upper sequence: GLYMA01G41620.3 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: Vv16s0013g02020.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttattgtattacttctgttgaaattgaaatttggttgtgaatcat---gtgttg--atttggtaaaagcttgtcatggt-gtttcag--------
|| ||||||||||| || |||||| | ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||||| | || | | || | | | || | || || |||||| | || |||| | |||| |
TCAGCTGAAATTTCAACGCAGCAAGCGTTCAATTGCAGAGGAACGTGCTGGACGGAAGCTGGGTGGTCTCAAGGTTCTCAACTCTTATTGGATCAATGAGgtctgtatagaatttactgcacttatttcctacctatgtatctcagtcttcgagttctgctatttgggcacttgttagcatgctagttttggtacatgat

upper sequence: GLYMA01G41620.3 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: Vv00s0551g00020.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttattgtattacttctgttgaaat--tgaaatttggttgtgaatcatgtgttgatttggtaaaagcttgtcatggtgtttcag-----------------------------
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||| |||| || |||| ||| ||||| || |||||| | |||||||||||| | ||| | | ||| || | | | |||| ||| ||| | | || || | | |
CCAACTGAAATTCCAGCGCAGCAAGAGGTCAGTTGCAGAGGAACGTGCTGGGCGAAAGTTGGGAGGTCTTAAGGTTCTCAACTCGTACTGGATCAATGAGgtttgtagtgtgattccattcaatgatatgatttgtcctatccagttgtaatgttttgctttctatattgttttacacactactgccattaatgataaaacgtttctgttgatgcag

upper sequence: GLYMA01G41620.3 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S34_445V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 3
CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttattgtat-tacttctgttgaaattgaaatttggttgtgaatcatgtgttgatttggtaaaagcttgtca-tggtgtttcag------------
|| || || || ||||| | | | | ||||| || |||||||| || ||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| | | | | |||||| || | | | | |||| | || || || | || ||
ACAGCTTAAGTTCCAGCGTAACTTGCGATCAGTAGCTGAGGAGCGGGCAGGAAGGAAGCTTGGAGGCCTTAGGGTCCTCAACTCTTACTGGATCAACCAGgtatgtccatatttatggatctgtttggtttttgtaataaacacaatcgagggtctgatcgttttgaatactgccaattaggtgcgagttgctaattaat

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|21889739|gb|BQ742952.1|BQ742952
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGT
EST: gi|209720139|gb|BW659499.1|BW659499
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|209720154|gb|BW659500.1|BW659500
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31309429|gb|CD394632.1|CD394632
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31457674|gb|CD399702.1|CD399702
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|298180302|gb|HO025503.1|HO025503
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTCGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|192306015|gb|FG993633.1|FG993633
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|209699233|gb|BW670193.1|BW670193
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|15287650|gb|BI471541.1|BI471541
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCT
EST: gi|33388238|gb|CA851445.1|CA851445
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31305290|gb|CD390493.1|CD390493
EST:     ACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACNTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTNTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGC
genomic: ACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTAC-TGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACT-TATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGC
EST: gi|7232366|gb|AW567723.1|AW567723
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTANGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|298194474|gb|HO042946.1|HO042946
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTGGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|151409188|gb|EV278996.1|EV278996
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31472012|gb|CD414040.1|CD414040
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGCTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|298164066|gb|HO013711.1|HO013711
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|192324387|gb|FK015738.1|FK015738
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|151393063|gb|EV262938.1|EV262938
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|6072513|gb|AW101900.1|AW101900
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|5819902|gb|AI988169.1|AI988169
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|7588250|gb|AW704050.1|AW704050
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|58019970|gb|CX706712.1|CX706712
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|192293950|gb|FG987119.1|FG987119
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|6725854|gb|AW310253.1|AW310253
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|15338221|gb|BI498885.1|BI498885
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|6072068|gb|AW101387.1|AW101387
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|9984067|gb|BE658224.1|BE658224
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|7028250|gb|AW458033.1|AW458033
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31471778|gb|CD413806.1|CD413806
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|4299201|gb|AI442870.1|AI442870
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|192319637|gb|FK013721.1|FK013721
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|8404282|gb|BE059916.1|BE059916
EST:     GTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|7029117|gb|AW458900.1|AW458900
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|23731204|gb|BU763714.1|BU763714
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|192323708|gb|FK016014.1|FK016014
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|9259367|gb|BE347514.1|BE347514
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|254319417|gb|GR830657.1|GR830657
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|7588297|gb|AW704096.1|AW704096
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31306550|gb|CD391753.1|CD391753
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|192331282|gb|FK023779.1|FK023779
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|298167401|gb|HO012664.1|HO012664
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31308627|gb|CD393830.1|CD393830
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTATGGTCCTCGATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|151411045|gb|EV280856.1|EV280856
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|15199241|gb|BI423731.1|BI423731
EST:     CGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: CGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|17023148|gb|BM094182.1|BM094182
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|9259246|gb|BE347454.1|BE347454
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|13563509|gb|BG551729.1|BG551729
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|33387885|gb|CA851092.1|CA851092
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|151399683|gb|EV269554.1|EV269554
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31476534|gb|CD418562.1|CD418562
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|308099173|gb|HO761014.1|HO761014
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|17518840|gb|BM187882.1|BM187882
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|192308065|gb|FK000393.1|FK000393
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|18717907|gb|BM523009.1|BM523009
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|208340480|gb|GE137862.1|GE137862
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTGGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|16348345|gb|BI973940.1|BI973940
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTGGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|10252692|gb|BE820458.1|BE820458
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|192325178|gb|FK019094.1|FK019094
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31311210|gb|CD396413.1|CD396413
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|298192833|gb|HO033267.1|HO033267
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTGGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|21601861|gb|BQ612192.1|BQ612192
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|11688999|gb|BF596605.1|BF596605
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|151402199|gb|EV272012.1|EV272012
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|18039959|gb|BM308253.1|BM308253
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|17401578|gb|BM178360.1|BM178360
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTGGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|192309193|gb|FG999434.1|FG999434
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|9439915|gb|BE440427.1|BE440427
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|20813197|gb|BQ297675.1|BQ297675
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCT
EST: gi|298183272|gb|HO028485.1|HO028485
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTGGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|4396474|gb|AI495471.1|AI495471
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|6567079|gb|AW234706.1|AW234706
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31466410|gb|CD408438.1|CD408438
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31464643|gb|CD406656.1|CD406656
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31460745|gb|CD402773.1|CD402773
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31464907|gb|CD406935.1|CD406935
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|12488669|gb|BG042192.1|BG042192
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|254319416|gb|GR830656.1|GR830656
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|13252064|gb|BG362967.1|BG362967
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31468973|gb|CD411001.1|CD411001
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|192306014|gb|FG993632.1|FG993632
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|298165936|gb|HO008907.1|HO008907
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTGGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|4287707|gb|AI441228.1|AI441228
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGGATGTTGCTCATGC
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGG-ATGTTGCTCATGC
EST: gi|16280794|gb|BI944149.1|BI944149
EST:     GGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31473896|gb|CD415924.1|CD415924
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|4296684|gb|AI442510.1|AI442510
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|208185123|gb|GD987475.1|GD987475
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGT
EST: gi|20075567|gb|BQ094350.1|BQ094350
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAAGTGATTCTGGTGGATGGTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|7925418|gb|AW831383.1|AW831383
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTANGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|14258822|gb|BG881730.1|BG881730
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|51342678|gb|CO983641.1|CO983641
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|9901629|gb|BE610597.1|BE610597
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|10848361|gb|BF070864.1|BF070864
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|31311127|gb|CD396330.1|CD396330
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|151408354|gb|EV278162.1|EV278162
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|10235054|gb|BE803942.1|BE803942
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|151393270|gb|EV263145.1|EV263145
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|11687608|gb|BF595284.1|BF595284
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|24136779|gb|BU927289.1|BU927289
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
EST: gi|6071154|gb|AW100541.1|AW100541
EST:     GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAG                         GACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT
genomic: GACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttatt ... ggtgtttcagGACTCTACTTATAAATACTTTGAGGTGATTCTGGTGGATGTTGCTCATGCT

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
CCAACTGAAATTTCAGCGAAGCAAGAGGTCAGTTGCCGAGGAGCGAGCTGGACGGAAGCTGGGTGGACTTAGGGTCCTCAATTCTTACTGGGTGAATGAGgtttgttattgtattacttctgttgaaattgaaatttggttgtgaatcatgtgttgatttggtaaaagcttgtcatggtgtttcag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGTGGA