Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCGAGAGGGTTAAAGAAACACCTGAAGAGGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacagtactcacaattgtcgatgatattattttactcaaatttatttgtaattttcatttgaactcatgtactcatttggcctggctctgtag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA01G31270.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA01G31270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: Vv06s0004g07150.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 2
GCGAGAGGGTTAAAGAAACACCTGAAGAGGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacagtactcacaattgtcgatgatattattttactcaaatttatttgtaattttcatttgaactcatgtactcatttggcctg-gctctgtag-----
||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||      ||     || ||  ||   ||   ||||| ||   | || |    |    ||| |  |  | | ||    || | |    |||||       
GCACGAGGGTTAAAGAAACATTTGAAGAGGCTTAATGCCCCAAAGCATTGGATGCTTGACAAACTTGGGGGTGCATTTgtaagtgataagctt----ttctcagtgtgtttccattacttaataatgttagaccctcgggttttacttgctttgctttaatgtcttataatctgtcatacag

upper sequence: GLYMA01G31270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S2_16V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCGAGAGGGTTAAAGAAACACCTGAAGAGGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacagta-ctcacaattgtcgatgatattattttactcaaatttatttgtaattttcatttgaactcatgtactcatttggcctggctctgtag---
||  | || || ||||| ||  |||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||     | ||  |  || |     |  ||   |   |||   |  |  | | || ||     | |||| | | ||   ||  | | ||| |      
GCTCGCGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAGGCACTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTTgtaagttttacatcttgcttttatactcaacgttcaatcg-tcatgctagtacgcatttctctgactatctcagggattcgaatg-tcagtctcagcgaatt

upper sequence: GLYMA01G31270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S81_172V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCGAGAGGGTTAAAGAAACACCTGAAGAGGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacagtactcacaattgtcgatgatattattttactcaaatttatttgtaattttcattt---gaactcatgtactcatttggcctggctctgtag-
||  | || || ||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||  || |  |       |       || | ||  |    ||   || || ||||||    |      |   || || |            |  |  | || 
GCTCGTGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAATTGGGTGGCGCCTTTgtgagttcttttactttgacctgaattggtgtttctggcttcg--ttgatctgtaataggaacgcacagggttcctggagctgcccccttagttttcgaagt

upper sequence: GLYMA01G31270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S282_25V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCGAGAGGGTTAAAGAAACACCTGAAGAGGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacagtactcac---aattgtcgatgatattattttactcaaatttatttgtaattttcatttgaactcatgtactcatttggcctggctctgtag-
||  | || || ||||| ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||  |  | |    ||||       || ||  |   |  ||  |   |||||  | |  |      | |  ||  | | |    ||   || | | 
GCTCGCGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCGCCTAAGCATTGGATGCTTGACAAGCTGGGTGGCGCCTTCgtgagtaccattttgaactgaattcatacctatgtttgtgagcggaaggtggcttgta--tctagtgcactgttagataggcttcttaaatgaaacttttgc

upper sequence: GLYMA01G31270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S461_1V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCGAGAGGGTTAAAGAAACACCTGAAGAGGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacagtactcacaattgtcgatgatattattttactcaaatttatttgtaattttcatttgaactcatgtactcatttggcctggctctgtag---
||  | || || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  || |    | |   | |  | |   |||   |  |  |  |||| ||   |   ||   | |    |||    |    ||    | |    ||    
GCTCGTGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtgagttcctagcccttgacttcccacc-tatctctgcatcctcattttttaaaatccttttataggtggcattctgtggaatgaatcgcccacctacctt

upper sequence: GLYMA01G31270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S38_194V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCGAGAGGGTTAAAGAAACACCTGAAGAGGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtaca-gtactcaca-attgtcgatgatattatt-ttactcaaatttatttgtaattttcatttgaactcatgtactcatttggcctggctctgtag
||  | || || ||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |      | ||  | | ||| ||||  || |  || |    |  |  |      ||   |||   | || |  | |   |   |  ||  |   
GCTCGCGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctcacgttgacctaatttcgctgatgctagtactatttgtgtcgacgtcgtgagttaggttgtggttatatttttacccgaattctcttcgac-

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298173349|gb|HO016685.1|HO016685
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGACTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|19054282|gb|BM732949.1|BM732949
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|13788286|gb|BG650878.1|BG650878
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|208182160|gb|GD980607.1|GD980607
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|17022544|gb|BM093578.1|BM093578
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|21888286|gb|BQ741499.1|BQ741499
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|213604822|gb|DB956135.1|DB956135
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|8827979|gb|BE211709.1|BE211709
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|298169248|gb|HO020608.1|HO020608
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|298182749|gb|HO031484.1|HO031484
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|26268188|gb|CA819251.1|CA819251
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|18041325|gb|BM309619.1|BM309619
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|19053906|gb|BM732573.1|BM732573
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|7926146|gb|AW832172.1|AW832172
EST:     GCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|209720298|gb|BW669258.1|BW669258
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|8827265|gb|BE210995.1|BE210995
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|298188320|gb|HO035013.1|HO035013
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|298188025|gb|HO031982.1|HO031982
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|192298439|gb|FG988455.1|FG988455
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|14259674|gb|BG882582.1|BG882582
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|192332454|gb|FK024215.1|FK024215
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|298190414|gb|HO032535.1|HO032535
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|213618374|gb|DB969372.1|DB969372
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|13481264|gb|BG510607.1|BG510607
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|15813058|gb|BI785333.1|BI785333
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|192298477|gb|FG988478.1|FG988478
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|298174877|gb|HO014794.1|HO014794
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|298194963|gb|HO043435.1|HO043435
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCTCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|16348683|gb|BI974269.1|BI974269
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
EST: gi|298197068|gb|HO041811.1|HO041811
EST:     GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCCTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTT                         GCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacag ... ggctctgtagGCACCCAAGCCATCATCTGGACCCCACAAGTCCCGGGAGTGTCTTCCTCTG

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GCGAGAGGGTTAAAGAAACACCTGAAGAGGCTCAATGCTCCAAAACATTGGATGCTTGACAAGCTTGGTGGTGCCTTTgtatgtacagtactcacaattgtcgatgatattattttactcaaatttatttgtaattttcatttgaactcatgtactcatttggcctggctctgtag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CAAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGGTGG