Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|208285987|gb|GE084673.1|GE084673EST: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAG GGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
genomic: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAGgtgagttgat ... attgctgtagGGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
EST:
gi|12691478|gb|BG157814.1|BG157814EST: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAG GGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
genomic: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAGgtgagttgat ... attgctgtagGGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
EST:
gi|208110819|gb|GD910917.1|GD910917EST: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAG GGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
genomic: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAGgtgagttgat ... attgctgtagGGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
EST:
gi|298172626|gb|HO019666.1|HO019666EST: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAG GGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
genomic: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAGgtgagttgat ... attgctgtagGGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
EST:
gi|298174411|gb|HO014556.1|HO014556EST: AAGTCCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAG GGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
genomic: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAGgtgagttgat ... attgctgtagGGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
EST:
gi|16347691|gb|BI973286.1|BI973286EST: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAG GGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
genomic: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAGgtgagttgat ... attgctgtagGGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
EST:
gi|298171850|gb|HO021442.1|HO021442EST: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAG GGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
genomic: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAGgtgagttgat ... attgctgtagGGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
EST:
gi|298175270|gb|HO018151.1|HO018151EST: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAG GGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
genomic: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAGgtgagttgat ... attgctgtagGGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
EST:
gi|298194153|gb|HO040801.1|HO040801EST: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAG GGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCCGAAATCAACAAAGAG
genomic: AAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAGgtgagttgat ... attgctgtagGGCCTACTGATGCAAATGAGCATGATGGCTACACCTGAAATCAACAAAGAG
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
GCATGTGTGCAGAAGAAATGGGGTTGTCACTGATATCAAGAGTCTCGGAAAAGTTCAGTTGGGCTATGGTGTGAAAAAGCTAGATGGCAGATATTATCAGgtgagttgattatctgtaatgttgtaacgagagtttatgcattataggttttttatatgctgttttataatgctttctttgatgtaagcattgcatgttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGAT