Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TAAAAAGATAAGTCAAGTTATACAAGCAAAGGGAGGACAGATAAGGATCTCATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTGgttagttgctgtggcttaaaggcattcatcacacgtgttgcatttgtttatggtgcattcattaggcttgtaattaaaagtcagttctttgaaattagat...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA12G37100.1
intron # 18
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298194073|gb|HO040721.1|HO040721
EST:     CATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTG                         GACACAATGGCTCGAAGACCTGCTGACCCTGAGGAAGAACTCCGATGGATG
genomic: CATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTGgttagttgct ... cccgtctcagGACACAATGGCTCGAAGACCTGCTGACCCTGAGGAAGAACTCCGATGGATG
EST: gi|13312451|gb|BG406102.1|BG406102
EST:     CATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTG                         GACACAATGGCTCGAAGACCTGCTGACCCTGAGGAAGAACTCCGATGGATG
genomic: CATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTGgttagttgct ... cccgtctcagGACACAATGGCTCGAAGACCTGCTGACCCTGAGGAAGAACTCCGATGGATG
EST: gi|9564156|gb|BE473665.1|BE473665
EST:     CATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTG                         GACACAATGGCTCGAAGACCTGCTGACCCTGAGGAAGAACTCCGATGGATG
genomic: CATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTGgttagttgct ... cccgtctcagGACACAATGGCTCGAAGACCTGCTGACCCTGAGGAAGAACTCCGATGGATG
EST: gi|209705823|gb|BW675928.1|BW675928
EST:     CATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTG                         GACACAATGGCTCGAAGACCTGCTGACCCTGAGGAAGAACTCCGATGGATG
genomic: CATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTGgttagttgct ... cccgtctcagGACACAATGGCTCGAAGACCTGCTGACCCTGAGGAAGAACTCCGATGGATG
EST: gi|151401960|gb|EV271773.1|EV271773
EST:     CATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTG                         GACACAATGGCTCGAAGACCTGCTGACCCTGAGGAAGAACTCCGACGGATG
genomic: CATCTGATGGTGCCCCTACTATGAGGCATAGCCTCTCTGATGGTTCCTTGgttagttgct ... cccgtctcagGACACAATGGCTCGAAGACCTGCTGACCCTGAGGAAGAACTCCGATGGATG