Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTTTGTTCAAAAAGGCTACTGGGTCAATGTTATCTCCACTCACAATGTTGATGGTTACCTGACTCAACCTGATGGGTCAAATGTGAATTTGAAAATTCGGgtacaacaattatagtccatcctaatatgtcagtacaattgcagcttcacaaaattcatttctgttcttttggtcttatctgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA03G37930.2
intron # 18
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|21639212|gb|BM253042.1|BM253042
EST:     ATGGTTACCTGACTCAACCTGATGGGTCAAATGTGAATTTGAAAATTCGG                         AAAGGTTTCCAGCATATATGTGTAGAACAACCTGGTGTACATGAATTTAGT
genomic: ATGGTTACCTGACTCAACCTGATGGGTCAAATGTGAATTTGAAAATTCGGgtacaacaat ... ttatctgcagAAAGGTTTCCAGCATATATGTGTAGAACAACCTGGTGTACATGAATTTAGT
EST: gi|120491323|gb|EH219490.1|EH219490
EST:     ATGGTTACCTGACTCAACCTGATGGGTCAAATGTGAATTTGAAAATTCGG                         AAAGGTTTCCAGCATATATGTGTAGAACAACCTGGTGTACATGAATTTAGT
genomic: ATGGTTACCTGACTCAACCTGATGGGTCAAATGTGAATTTGAAAATTCGGgtacaacaat ... ttatctgcagAAAGGTTTCCAGCATATATGTGTAGAACAACCTGGTGTACATGAATTTAGT
EST: gi|16348153|gb|BI973748.1|BI973748
EST:     ATGGTTACCTGACTCAACCTGATGGGTCAAATGTGAATTTGAAAATTCGG                         AAAGGTTTCCAGCATATATGTGTAGAACAACCTGGTGTACATGAATTTAGT
genomic: ATGGTTACCTGACTCAACCTGATGGGTCAAATGTGAATTTGAAAATTCGGgtacaacaat ... ttatctgcagAAAGGTTTCCAGCATATATGTGTAGAACAACCTGGTGTACATGAATTTAGT