1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' |
GGCAGAGGTCGGGGCTGCTGTGCTTCGAGCAGCAGTTGAAGAAGAACTGGCAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAAgtatggaaaattttcagattacacatctttgtgatattgttaaactactgtctactggagaatctgccattaagtgaatgctactagtctataatgtattgacatctctgaacattgcaaaatcaatgagaattgctaactgggtggttaatgttgcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA03G01680.1 |
intron # | 18 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAA GATGAGGCTGTGGAGTATGTGCGAAGCAATATGTGEST: gi|208308926|gb|GE101640.1|GE101640
genomic: CAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAAgtatggaaaa ... aatgttgcagGATGAGGCTGTGGAGTATGTGCGAAGCAATATGTG
EST: CAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAA GATGAGGCTGTGGNGTNTGTGCGAAGEST: gi|208244960|gb|GE043425.1|GE043425
genomic: CAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAAgtatggaaaa ... aatgttgcagGATGAGGCTGTGGAGTATGTGCGAAG
EST: CAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAA GATGAGGCTGTGGAGTATGTGCGAAGCAATATGTGGTATCCTGTGEST: gi|207704439|gb|GD684106.1|GD684106
genomic: CAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAAgtatggaaaa ... aatgttgcagGATGAGGCTGTGGAGTATGTGCGAAGCAATATGTGGTATCCTGTG
EST: CAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAA GATGAGGCTGTGGAGTATGTGCGAAGCAATATGTGGTATEST: gi|208161761|gb|GD962661.1|GD962661
genomic: CAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAAgtatggaaaa ... aatgttgcagGATGAGGCTGTGGAGTATGTGCGAAGCAATATGTGGTAT
EST: CAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAA GATGAGGCTGTGGAGTATGTGCGAAGCAATATGTGGTATCCTGTGTATTCT
genomic: CAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAAgtatggaaaa ... aatgttgcagGATGAGGCTGTGGAGTATGTGCGAAGCAATATGTGGTATCCTGTGTATTCT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGCAGAGGTCGGGGCTGCTGTGCTTCGAGCAGCAGTTGAAGAAGAACTGGCAGAAGGACATGGTGATGTGGGGCCCAAGGAACTTTCCCATATGTCAAAAgtatggaaaattttcagattacacatctttgtgatattgttaaactactgtctactggagaatctgccattaagtgaatgctactagtctataatgtattgacatctctgaacattgcaaaatcaatgagaattgctaactgggtggttaatgttgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAA