Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATCTTTTCGGGAATATGGAGAAGCTGTGCTGAAACATTTGGAGAATTCAATTGGCTCTGATCCAAGTCTGCTCAAGGCTCCTGTGAACTATGAAGGGgtatgtttatccctgctgcttattgctaaatagtaaagcctgtttagttagcattgaccataaaattcagccacattattgagacagttatgactaacgt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G35490.1
intron # 17
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|17020916|gb|BM091950.1|BM091950
EST:     CAATTGGCTCTGATCCAAGTCTGCTCAAGGCTCCTGTGAACTATGAAGGG                         GTCCGAGTTTCTGGCTATGGTGGATGGTTCCTTCTTAGATTATCACTCCAT
genomic: CAATTGGCTCTGATCCAAGTCTGCTCAAGGCTCCTGTGAACTATGAAGGGgtatgtttat ... cttcaaccagGTCCGAGTTTCTGGCTATGGTGGATGGTTCCTTCTTAGATTATCACTCCAT
EST: gi|12687900|gb|BG154296.1|BG154296
EST:     CAATTGGCTCTGATCCAAGTCTGCTCAAGGCTCCTGTGAACTATGAAGGG                         GTCCGAGTTTCTGGCTATGGTGGATGGTTCCTTCTTAGATTATCACTCCAT
genomic: CAATTGGCTCTGATCCAAGTCTGCTCAAGGCTCCTGTGAACTATGAAGGGgtatgtttat ... cttcaaccagGTCCGAGTTTCTGGCTATGGTGGATGGTTCCTTCTTAGATTATCACTCCAT
EST: gi|58023217|gb|CX709958.1|CX709958
EST:     CAATTGGCTCTGATCCAAGTCTGCTCAAGGCTCCTGTGAACTATGAAGGG                         GTCCGAGTTTCTGGCTATGGTGGATGGTTCCTTCTTAGATTATCACTCCAT
genomic: CAATTGGCTCTGATCCAAGTCTGCTCAAGGCTCCTGTGAACTATGAAGGGgtatgtttat ... cttcaaccagGTCCGAGTTTCTGGCTATGGTGGATGGTTCCTTCTTAGATTATCACTCCAT
EST: gi|57575221|gb|CX548196.1|CX548196
EST:     CAATTGGCTCTGATCCAAGTCTGCTCAAGGCTCCTGTGAACTATGAAGGG                         GTCCGAGTTTCTGGCTATGGTGGATGGTTCCTTCTTAGATTATCACTCCAT
genomic: CAATTGGCTCTGATCCAAGTCTGCTCAAGGCTCCTGTGAACTATGAAGGGgtatgtttat ... cttcaaccagGTCCGAGTTTCTGGCTATGGTGGATGGTTCCTTCTTAGATTATCACTCCAT