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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ACTCTTAGCAGAAGAGAGAATACTTCTATCAAATCCACCTCTTGAGCCAGGGTTACCAGCCATCTCGATCAAGAATGGATACTTTTCTTGGGATACGAAGgttcatatccttttgacatccttatgcttctattctagtcattatatatatatatccatttgcttgcagacagggaggaatgcacatacttgagtatggg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA13G29180.1
intron # 16
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA13G29180.1 (Glycine max), 5'ss of exon 16
lower sequence: Vv10s0003g04390.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 16
ACTCTTAGCAGAAGAGAGAATACTTCTATCAAATCCACCTCTTGAGCCAGGGTTACCAGCCATCTCGATCAAGAATGGATACTTTTCTTGGGATACGAAGgttcatatccttttgacatccttatgcttctattctagtcattatatatatatatccatttgcttgcagac---agggaggaatgcacatacttgagtatggg-
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ATTCTTAGCTGAAGAGAGAATTCTTCTACCAAATCCACCTCTTGAACCTGGACTTCCAGCCATCTCAATCAAGAATGGATACTTTTCTTGGGATTCAAAGgtctatatc---ttaac-tttttgtgtgcggccccccatactcccccccacacacccccctgcccccgggccccagccccacacacacacacagagacatgggt