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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGCATAGAGCTTGCACAGAGAGAGAGATACTCGACATGTTGGACCACCCTTTTCTTCCTGCATTATATGCTTCCTTTCAGgtttgtaactctagtgcacttcaaagtaagatagttatagagaataatgaaattggaactaaaactatcattggttgcagatacaagtacaatatgagtt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA12G07890.2
intron # 16
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA12G07890.2 (Glycine max), 5'ss of exon 16
lower sequence: Vv06s0004g03700.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 15
GTGCATAGAGCTTGCACAGAGAGAGAGATACTCGACATGTTGGACCACCCTTTTCTTCCTGCATTATATGCTTCCTTTCAGgtttgtaactctagtgcacttcaaag-taagatagttatagagaataatgaaattgg-aactaaaactatcattggttgcagatacaagtacaatatgagtt
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GTGCATAGAGCTTGTGCTGAAAGAGAAATTCTTGACATGTTGGATCACCCTTTTCTTCCCGCATTATATGCTTCATTTCAGgttagacaattttataaatataaaaaatgtagtagatggatagacacacataatgggtaactgctaaatttaattgtctgataaataaatgcctctgcaa--