Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GATTATGGTTCTACTGTGAAATTGCTATTGGATTTTGAGTTACTGAACCAGgtattgcacctatgctcctcatctccctttatttagagctgttccacaccttgtaatttgtggtggtggtgcatccctgcttggtgatgcagcactggaa...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA05G27900.2
intron # 16
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193301317|gb|FK266420.1|FK266420
EST:     ATTATGGTTCTACTGTGAAATTGCTATTGGATTTTGAGTTACTGAACCAG                         ATGCATTTTGATGATGCATATGGTGCTTACTTTGATTTTGGAAATCATACA
genomic: ATTATGGTTCTACTGTGAAATTGCTATTGGATTTTGAGTTACTGAACCAGgtattgcacc ... gtctatacagATGCATTTTGATGATGCATATGGTGCTTACTTTGATTTTGGAAATCATACA
EST: gi|208219729|gb|GE016655.1|GE016655
EST:     CTATTGGATTTTGAGCTACTGAACCAG                         ATGCATTTTGATGATGCATATGGTGCTTACTTTGATTTTGGAAATCATACA
genomic: CTATTGGATTTTGAGTTACTGAACCAGgtattgcacc ... gtctatacagATGCATTTTGATGATGCATATGGTGCTTACTTTGATTTTGGAAATCATACA
EST: gi|208196940|gb|GE001060.1|GE001060
EST:     ATTATGGTTCTACTGTGAAATTGCTATTGGATTTTGAGTTACTGAACCAG                         ATGCATTTTGATGATGCATATGGTGCTTACTTTGATTTTGGAAATCATACA
genomic: ATTATGGTTCTACTGTGAAATTGCTATTGGATTTTGAGTTACTGAACCAGgtattgcacc ... gtctatacagATGCATTTTGATGATGCATATGGTGCTTACTTTGATTTTGGAAATCATACA
EST: gi|13480605|gb|BG509948.1|BG509948
EST:     ATTATGGTTCTACTGTGAAATTGCTATTGGATTTTGAGTTACTGAACCAG                         ATGCATTTTGATGATGCATATG
genomic: ATTATGGTTCTACTGTGAAATTGCTATTGGATTTTGAGTTACTGAACCAGgtattgcacc ... gtctatacagATGCATTTTGATGATGCATATG
EST: gi|208276012|gb|GE074306.1|GE074306
EST:     ATTATGGTTCTACTGTGAAATTGCTATTGGATTTTGAGTTACTGAACCAG                         ATGCATTTTGATGATGCATATGGTGCTTACTTTGATTTTGGAAATCATACA
genomic: ATTATGGTTCTACTGTGAAATTGCTATTGGATTTTGAGTTACTGAACCAGgtattgcacc ... gtctatacagATGCATTTTGATGATGCATATGGTGCTTACTTTGATTTTGGAAATCATACA