Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CAGTGTTGAAAGGAAATTATATTTTTGTGAATGCTCCAAAAGAGACGTTAACTAATGTCCCGTACCCTTCAAAAGGATACAACTTCTCCGTGAAATTCAGgtttgtaataataacacctgagtttaacttggtttgaatgtcatcaacctttaactacatttctgactgaattgtaattgtaattcctacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA05G09020.1
intron # 16
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|207732294|gb|GD706269.1|GD706269
EST:     ACTAATGTCCCGTACCCTTCAAAAGGATACAACTTCTCCGTGAAATTCAG                         TGAATCTCTTGGTGCACCTGGAGAAAAGAAGAGAATTTTATTCAATTGTAG
genomic: ACTAATGTCCCGTACCCTTCAAAAGGATACAACTTCTCCGTGAAATTCAGgtttgtaata ... attcctacagTGAATCCCTTGGTGCACCTGGAGAAAAGAAGAGAATTTTATTCAATTGTAG
EST: gi|16997141|gb|BM086513.1|BM086513
EST:     ACTAATGTCCCGTACCCTTCAAAAGGATACAACTTCTCCGTGAAATTCAG                         TGAATCCCTTGGTGCACCTGGAGAAAA
genomic: ACTAATGTCCCGTACCCTTCAAAAGGATACAACTTCTCCGTGAAATTCAGgtttgtaata ... attcctacagTGAATCCCTTGGTGCACCTGGAGAAAA
EST: gi|208139715|gb|GD937739.1|GD937739
EST:     ACTAATGTCCCGTACCCTTCAAAAGGATACAACTTCTCCGTGAAATTCAG                         TGAATCTCTTGGTGCACCTGGAGAAAAGAAGAGAATTTTATTCAATTGTAG
genomic: ACTAATGTCCCGTACCCTTCAAAAGGATACAACTTCTCCGTGAAATTCAGgtttgtaata ... attcctacagTGAATCCCTTGGTGCACCTGGAGAAAAGAAGAGAATTTTATTCAATTGTAG