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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAGgtgagatgctgcattctgtttgtgtctgagcatttgtaaaggaatgctgtaatggtacgtgaagtttgttttgccatttccag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA04G00200.1
intron # 16
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|10254009|gb|BE821775.1|BE821775
EST:     GTTGATTNGAAATNAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAG                         GATAAATATTCTATGNACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
genomic: GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAGgtgagatgct ... ccatttccagGATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
EST: gi|208279807|gb|GE078451.1|GE078451
EST:     GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAG                         GATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
genomic: GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAGgtgagatgct ... ccatttccagGATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
EST: gi|17400899|gb|BM177681.1|BM177681
EST:     GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAG                         GATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
genomic: GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAGgtgagatgct ... ccatttccagGATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
EST: gi|193578353|gb|FK537573.1|FK537573
EST:     GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAG                         GATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
genomic: GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAGgtgagatgct ... ccatttccagGATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
EST: gi|208266208|gb|GE064543.1|GE064543
EST:     GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAG                         GATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
genomic: GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAGgtgagatgct ... ccatttccagGATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
EST: gi|208310396|gb|GE103796.1|GE103796
EST:     TGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAG                         GATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
genomic: TGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAGgtgagatgct ... ccatttccagGATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
EST: gi|207826963|gb|GD801138.1|GD801138
EST:     GTTGATTGGAA-TTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAG                         GATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
genomic: GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAGgtgagatgct ... ccatttccagGATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
EST: gi|308098353|gb|HO760094.1|HO760094
EST:     GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAG                         GATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
genomic: GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAGgtgagatgct ... ccatttccagGATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
EST: gi|14011124|gb|BG726055.1|BG726055
EST:     GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAG                         GATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC
genomic: GTTGATTGGAAATTAATGGATCTGAGCTATTTACTGGAGgtgagatgct ... ccatttccagGATAAATATTCTATGCACTTTGCGAATGTTATTAAGAAAGCTACACCTGTC