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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGGAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgccttgttgcattcaacttttgggttattaccactccgatgaccaagttcaacattttaatgcttcctttttcttgaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G37520.1
intron # 15
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA19G37520.1 (Glycine max), 5'ss of exon 15
lower sequence: Vv08s0007g03960.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 15
TGGAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgccttg--ttgcattcaac----ttttgggttattaccactccgatgaccaagttcaacattttaatgcttcctttttcttgaacag
|||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    ||  ||  |||  |       ||   ||   | | ||  | || |  |  | | | || |    |||    || | |   |||
TGGAGAAACTGAGGACACTTTCATTGCTGATCTTTCTGTGGGTTTGGCCACGgtaattatatgctttaaatttgagggaacattatttttagagccctttggtgtctcaactgatctttcttccccttgaaattgcgttggcag
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|11689246|gb|BF596922.1|BF596922
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|151393954|gb|EV263825.1|EV263825
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|15662135|gb|BI699506.1|BI699506
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|6566448|gb|AW234093.1|AW234093
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|209713143|gb|BW653852.1|BW653852
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|213592747|gb|DB981279.1|DB981279
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|214007339|gb|DB986930.1|DB986930
EST:     AGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTG-GAGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATA
genomic: AGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTG-GCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATA
EST: gi|209728018|gb|BW666740.1|BW666740
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|27425654|gb|CA937174.1|CA937174
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|21889620|gb|BQ742833.1|BQ742833
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|209716342|gb|BW676896.1|BW676896
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|209725451|gb|BW658304.1|BW658304
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|254315248|gb|GR830241.1|GR830241
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|6502429|gb|AW203802.1|AW203802
EST:     TTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: TTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|51335443|gb|CO979309.1|CO979309
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|19935365|gb|BQ080395.1|BQ080395
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|207697644|gb|GD680485.1|GD680485
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|209716492|gb|BW676942.1|BW676942
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|207822899|gb|GD793700.1|GD793700
EST:     GACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGATTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|4300358|gb|AI443036.1|AI443036
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|254320730|gb|GR827179.1|GR827179
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|18690784|gb|BM519632.1|BM519632
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|209716148|gb|BW662333.1|BW662333
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|17021632|gb|BM092666.1|BM092666
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|16348013|gb|BI973608.1|BI973608
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|7285161|gb|AW597648.1|AW597648
EST:     AGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: AGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|13481453|gb|BG510796.1|BG510796
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|21888828|gb|BQ742041.1|BQ742041
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|209703742|gb|BW656875.1|BW656875
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|58024814|gb|CX711555.1|CX711555
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|4302667|gb|AI443366.1|AI443366
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|120491912|gb|EH220079.1|EH220079
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|192332025|gb|FK026319.1|FK026319
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGGGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|23063689|gb|BU578600.1|BU578600
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAG
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAG
EST: gi|209708401|gb|BW665376.1|BW665376
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|31461422|gb|CD403450.1|CD403450
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|14516239|gb|BI094911.1|BI094911
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|14990742|gb|BI316415.1|BI316415
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAATACTGGAGCTCCATGCANGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|254325332|gb|GR838213.1|GR838213
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|6846455|gb|AW348745.1|AW348745
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|14516240|gb|BI094912.1|BI094912
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|22522608|gb|BU081419.1|BU081419
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|213603040|gb|DB980964.1|DB980964
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|11687443|gb|BF595119.1|BF595119
EST:     GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACG                         GGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
genomic: GAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgcctt ... tcttgaacagGGTCAAATTAAGACTGGAGCTCCATGCAGGTCTGAGCGTCTTGCTAAATAT
EST: gi|18730034|gb|BM525642.1|BM525642
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
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TGGAGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGACCTTTCTGTTGGTTTGGCTACGgtattgccttgttgcattcaacttttgggttattaccactccgatgaccaagttcaacattttaatgcttcctttttcttgaacag

- - - - - GAGGAT