Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGATGTCGTTCACATGGTCAGTTATGCGCCACTCTTTGTAAACACAAATGATAGAAAgtaattttctcacactttatcataggttttttttatcatctaacaatcatcttttttttttaatcttattttatgatgtgtggatcgatattatttaatttttatggcaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G30150.1
intron # 15
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA19G30150.1 (Glycine max), 5'ss of exon 15
lower sequence: AT3G10740.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 15
TGATGTCGTTCACATGGTCAGTTATGCGCCACTCTTTGTAAACACAAATGATAGAAAgtaattttctcacactttatcataggttttttttatca------tctaacaatcatcttttttttttaatcttattttatgatgtgtggatcgatattatttaatttttatggcaacag
|||  | ||| | ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||  | || |  |||||  | |  |  |  ||  |||      |    |||| ||||    || ||||  |  ||| |                                        
TGACATTGTTGAAATGGCAAGTTATGCTCCACTCTTTGTGAACACAAATGATAGACGgtatctctcacttacttttccgttcgaatggttactcaggaagataaggcaataatctcaaattgttaaattggtttcag---------------------------------------