Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   
9  
 5'  3'   
10  
 5'  3'   
11  
 5'  3'   
12  
 5'  3'   
13  
 5'  3'   
14  
 5'  3'   
15  
 5'  3'   
16  
 5'  3'   
17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGATGTCGTTCACATGGTCAGTTATGCGCCACTCTTTGTAAACACAAATGATAGAAAgtaattttctcacactttatcataggttttttttatcatctaacaatcatcttttttttttaatcttattttatgatgtgtggatcgatattatttaatttttatggcaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G30150.1
intron # 15
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA19G30150.1 (Glycine max), 5'ss of exon 15
lower sequence: AT3G10740.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 15
TGATGTCGTTCACATGGTCAGTTATGCGCCACTCTTTGTAAACACAAATGATAGAAAgtaattttctcacactttatcataggttttttttatca------tctaacaatcatcttttttttttaatcttattttatgatgtgtggatcgatattatttaatttttatggcaacag
||| | ||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || | ||||| | | | | || ||| | |||| |||| || |||| | ||| |
TGACATTGTTGAAATGGCAAGTTATGCTCCACTCTTTGTGAACACAAATGATAGACGgtatctctcacttacttttccgttcgaatggttactcaggaagataaggcaataatctcaaattgttaaattggtttcag---------------------------------------