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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTCAGACTCCCATTGTACGCACTAGTACATATACTAAATACAACATTGATGAATTTCCAACAGGCACAAATGCTATAGTCGCAGTTCTGGCATATACAGGgtaactgctttaatacaaagcaactgtaattttaaccttcctgtgctgtttacaaatatcttgtgttatctaattacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA17G23500.1
intron # 15
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA17G23500.1 (Glycine max), 5'ss of exon 15
lower sequence: Vv13s0084g00600.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 20
CTCAGACTCCCATTGTACGCACTAGTACATATACTAAATACAACATTGATGAATTTCCAACAGGCACAAATGCTATAGTCGCAGTTCTGGCATATACAGGgtaactgcttta-atacaaa-gcaactgtaattttaaccttcctgtg-ctgtttacaaatatcttgtgttatctaattacag
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CTCAAACTCCCATTGTTCGTACAAGTGCATATGTGAAGTACAGCATGGACGAATTTCCAACAGGGACAAATGCAATTGTTGCTGTTCTAGCATATTCAGGgtaaaaattttagatgaatatgaagacatatatttcattttatagcatctgtatgattggttttttcgtaaattatccag--