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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTGCCGAGTTATATGATTTTGATGATGAGAAGgtaaacatgacacattgttttatctttggcaactttttgtattgctttgtatcaaccctactctcctcctttcccttgttatctatttaactgacattggcatatcaatttccctttttaaataaag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA15G10370.1
intron # 15
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA15G10370.1 (Glycine max), 5'ss of exon 15
lower sequence: AC235535.1_FGT001 (Zea mays), 5'ss of exon 15
CTGCCGAGTTATATGATTTTGATGATGAGAAGgtaaacatg-acacatt-gttttatct-ttggcaactttttgtattgctttgtatcaaccctactctcctcct-ttcccttgttatctat--ttaactgacattggcatatcaatttccctttttaaataaag
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ATGCCGAACTGTATGATTTTGATGATGAGAAGgtaatgattcaaacattcaattcatgtgctgtaaattgtgagtgtttttttg-acgtgtcttgctcaacaccaattaaattctcctccatgattgcttgaag-------------------------------