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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGCATAGAGCTTGCGCAGAGAGAGAAATTCTTGACAAGTTGGACCACCCCTTTCTACCTGCATTATATGCTTCCTTTCAGgtttgaaaacacaatgaattatttatcaattagaataactggcaagaacgttaggatatttttaggaattatagagttccaatatgtcttgagctggatt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA15G04850.1
intron # 15
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA15G04850.1 (Glycine max), 5'ss of exon 15
lower sequence: Vv06s0004g03700.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 15
GTGCATAGAGCTTGCGCAGAGAGAGAAATTCTTGACAAGTTGGACCACCCCTTTCTACCTGCATTATATGCTTCCTTTCAGgtttgaaaacacaatgaatt--atttatcaattagaataactggcaagaacgttaggatatttttaggaattatagagttccaatatgtcttgagctggatt
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GTGCATAGAGCTTGTGCTGAAAGAGAAATTCTTGACATGTTGGATCACCCTTTTCTTCCCGCATTATATGCTTCATTTCAGgttagacaattttataaatataaaaaatgtagtagatggatagacacacataatgggtaactgctaaatttaattgtctgataa-ataaatgcctctgcaa-